29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_4456 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_4456  hypothetical protein  100 
 
 		 133 aa  248  2e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00696256 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2202  conserved hypothetical protein; putative secreted protein  63.21 
 
 		 135 aa  124  3e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.184904  normal  0.817106 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2245  hypothetical protein  59.46 
 
 		 135 aa  125  3e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.702566  normal  0.472151 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2520  hypothetical protein  60.38 
 
 		 135 aa  121  3e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.586932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3735  hypothetical protein  57.58 
 
 		 135 aa  99.4  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.722442  normal  0.0462573 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2903  hypothetical protein  38.64 
 
 		 134 aa  94  6e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.203392  normal  0.153041 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3997  hypothetical protein  30.82 
 
 		 161 aa  75.9  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0383  hypothetical protein  38.76 
 
 		 145 aa  74.3  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00782707 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0415  hypothetical protein  35.66 
 
 		 147 aa  73.6  0.0000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0438215  hitchhiker  0.000233911 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2190  hypothetical protein  29.5 
 
 		 158 aa  70.9  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2142  hypothetical protein  30.94 
 
 		 158 aa  69.3  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0940  hypothetical protein  31.03 
 
 		 155 aa  63.9  0.0000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0606896  hitchhiker  0.00778912 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3369  hypothetical protein  36.84 
 
 		 165 aa  60.8  0.000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.867444  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5640  hypothetical protein  33.33 
 
 		 177 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00146587  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1081  hypothetical protein  33.65 
 
 		 145 aa  57.4  0.00000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.129849 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0724  hypothetical protein  33.58 
 
 		 149 aa  56.6  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.108952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2301  hypothetical protein  30.83 
 
 		 147 aa  54.7  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0919  hypothetical protein  56.1 
 
 		 118 aa  53.5  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.404023  normal  0.0701309 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1867  hypothetical protein  35.94 
 
 		 174 aa  52.8  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0934  hypothetical protein  28.06 
 
 		 156 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2661  hypothetical protein  29.31 
 
 		 137 aa  50.8  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.343805  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2922  hypothetical protein  26.28 
 
 		 171 aa  50.1  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0898761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2359  hypothetical protein  33.56 
 
 		 181 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0847029  normal  0.335248 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0866  hypothetical protein  31.58 
 
 		 153 aa  48.5  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.171288  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6041  hypothetical protein  31.39 
 
 		 147 aa  48.5  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.970972  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3682  hypothetical protein  33.06 
 
 		 175 aa  45.1  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.840145  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3971  hypothetical protein  33.85 
 
 		 153 aa  44.3  0.0006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000073  hypothetical protein  26.76 
 
 		 146 aa  43.1  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05688  hypothetical protein  24.63 
 
 		 146 aa  42  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>