21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_0724 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_0724  hypothetical protein  100 
 
 		 149 aa  292  1e-78  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.108952  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1867  hypothetical protein  61.95 
 
 		 174 aa  147  4e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2301  hypothetical protein  62.18 
 
 		 147 aa  143  9e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6041  hypothetical protein  58.82 
 
 		 147 aa  135  2e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.970972  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0866  hypothetical protein  58.82 
 
 		 153 aa  135  2e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.171288  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3369  hypothetical protein  56.76 
 
 		 165 aa  127  6e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.867444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3682  hypothetical protein  59.09 
 
 		 175 aa  125  2.0000000000000002e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.840145  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3997  hypothetical protein  33.55 
 
 		 161 aa  65.9  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0934  hypothetical protein  34.96 
 
 		 156 aa  63.9  0.0000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0940  hypothetical protein  25.16 
 
 		 155 aa  56.2  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0606896  hitchhiker  0.00778912 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2903  hypothetical protein  30.09 
 
 		 134 aa  51.6  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.203392  normal  0.153041 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4456  hypothetical protein  36.19 
 
 		 133 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00696256 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2245  hypothetical protein  32.11 
 
 		 135 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.702566  normal  0.472151 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2202  conserved hypothetical protein; putative secreted protein  31.19 
 
 		 135 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.184904  normal  0.817106 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2520  hypothetical protein  32.08 
 
 		 135 aa  47.8  0.00006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.586932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0919  hypothetical protein  29.52 
 
 		 118 aa  45.8  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.404023  normal  0.0701309 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2142  hypothetical protein  28.12 
 
 		 158 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2190  hypothetical protein  27.56 
 
 		 158 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1081  hypothetical protein  30.69 
 
 		 145 aa  43.5  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.129849 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0383  hypothetical protein  30.5 
 
 		 145 aa  42.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00782707 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000073  hypothetical protein  30 
 
 		 146 aa  40.8  0.006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>