25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_0383 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_0383  hypothetical protein  100 
 
 
145 aa  288  1e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00782707 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0415  hypothetical protein  88.97 
 
 
147 aa  266  8.999999999999999e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0438215  hitchhiker  0.000233911 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2202  conserved hypothetical protein; putative secreted protein  39.66 
 
 
135 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.184904  normal  0.817106 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2245  hypothetical protein  38.14 
 
 
135 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.702566  normal  0.472151 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3997  hypothetical protein  32.5 
 
 
161 aa  66.2  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2520  hypothetical protein  39.29 
 
 
135 aa  66.2  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.586932  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2922  hypothetical protein  35.71 
 
 
171 aa  64.7  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0898761  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2661  hypothetical protein  34.82 
 
 
137 aa  62.4  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.343805  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4456  hypothetical protein  38.89 
 
 
133 aa  61.2  0.000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00696256 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1081  hypothetical protein  30.22 
 
 
145 aa  60.1  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.129849 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1867  hypothetical protein  37.61 
 
 
174 aa  56.6  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2142  hypothetical protein  30.83 
 
 
158 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2903  hypothetical protein  26.76 
 
 
134 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.203392  normal  0.153041 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2190  hypothetical protein  30.08 
 
 
158 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3735  hypothetical protein  33.33 
 
 
135 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.722442  normal  0.0462573 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6041  hypothetical protein  32.28 
 
 
147 aa  43.9  0.0008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.970972  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0866  hypothetical protein  32.03 
 
 
153 aa  43.5  0.0009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.171288  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5640  hypothetical protein  35.63 
 
 
177 aa  43.5  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00146587  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0919  hypothetical protein  45.24 
 
 
118 aa  43.1  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.404023  normal  0.0701309 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0724  hypothetical protein  30.5 
 
 
149 aa  42.4  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.108952  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2301  hypothetical protein  28.89 
 
 
147 aa  42.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0940  hypothetical protein  28 
 
 
155 aa  41.6  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0606896  hitchhiker  0.00778912 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0934  hypothetical protein  30.37 
 
 
156 aa  41.6  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1032  hypothetical protein  27.48 
 
 
144 aa  41.2  0.005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000073  hypothetical protein  25.44 
 
 
146 aa  40.4  0.008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>