19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_0415 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_0415  hypothetical protein  100 
 
 
147 aa  296  8e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0438215  hitchhiker  0.000233911 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0383  hypothetical protein  88.97 
 
 
145 aa  266  8.999999999999999e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00782707 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2922  hypothetical protein  38.26 
 
 
171 aa  70.5  0.000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0898761  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2245  hypothetical protein  36.13 
 
 
135 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.702566  normal  0.472151 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2202  conserved hypothetical protein; putative secreted protein  36.75 
 
 
135 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.184904  normal  0.817106 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2520  hypothetical protein  36.84 
 
 
135 aa  67.4  0.00000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.586932  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2661  hypothetical protein  37.5 
 
 
137 aa  66.2  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.343805  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3997  hypothetical protein  31.09 
 
 
161 aa  60.8  0.000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4456  hypothetical protein  32.74 
 
 
133 aa  60.5  0.000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00696256 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1081  hypothetical protein  32.73 
 
 
145 aa  57.4  0.00000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.129849 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1867  hypothetical protein  36.21 
 
 
174 aa  53.1  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2142  hypothetical protein  28.8 
 
 
158 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2903  hypothetical protein  27.14 
 
 
134 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.203392  normal  0.153041 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3735  hypothetical protein  32.41 
 
 
135 aa  47.4  0.00006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.722442  normal  0.0462573 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2190  hypothetical protein  28 
 
 
158 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000073  hypothetical protein  28.95 
 
 
146 aa  42.7  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5640  hypothetical protein  34.48 
 
 
177 aa  41.2  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00146587  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0919  hypothetical protein  46.34 
 
 
118 aa  40.8  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.404023  normal  0.0701309 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6041  hypothetical protein  30 
 
 
147 aa  40.4  0.009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.970972  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>