14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_6041 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_6041  hypothetical protein  100 
 
 		 147 aa  290  3e-78  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.970972  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0866  hypothetical protein  99.32 
 
 		 153 aa  288  1e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.171288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2301  hypothetical protein  83.67 
 
 		 147 aa  219  9e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0724  hypothetical protein  58.82 
 
 		 149 aa  135  2e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.108952  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3682  hypothetical protein  58.82 
 
 		 175 aa  117  6e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.840145  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3369  hypothetical protein  49.24 
 
 		 165 aa  112  1.0000000000000001e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.867444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1867  hypothetical protein  49.11 
 
 		 174 aa  112  1.0000000000000001e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3997  hypothetical protein  24 
 
 		 161 aa  50.8  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0934  hypothetical protein  27.13 
 
 		 156 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0940  hypothetical protein  26.67 
 
 		 155 aa  45.1  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0606896  hitchhiker  0.00778912 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0383  hypothetical protein  32.28 
 
 		 145 aa  43.9  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00782707 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2202  conserved hypothetical protein; putative secreted protein  26.61 
 
 		 135 aa  40.8  0.007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.184904  normal  0.817106 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4456  hypothetical protein  30.36 
 
 		 133 aa  40.4  0.009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00696256 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0415  hypothetical protein  30 
 
 		 147 aa  40.4  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0438215  hitchhiker  0.000233911 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>