29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_3997 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_3997  hypothetical protein  100 
 
 
161 aa  329  9e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2142  hypothetical protein  42.74 
 
 
158 aa  92  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0940  hypothetical protein  30.32 
 
 
155 aa  91.3  5e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0606896  hitchhiker  0.00778912 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2190  hypothetical protein  42.74 
 
 
158 aa  90.9  7e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2245  hypothetical protein  36.67 
 
 
135 aa  84  8e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.702566  normal  0.472151 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2520  hypothetical protein  36.21 
 
 
135 aa  81.3  0.000000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.586932  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2202  conserved hypothetical protein; putative secreted protein  33.33 
 
 
135 aa  78.6  0.00000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.184904  normal  0.817106 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0934  hypothetical protein  31.11 
 
 
156 aa  69.7  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2903  hypothetical protein  34.51 
 
 
134 aa  68.2  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.203392  normal  0.153041 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0383  hypothetical protein  32.5 
 
 
145 aa  66.2  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00782707 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4456  hypothetical protein  31.67 
 
 
133 aa  66.2  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00696256 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0724  hypothetical protein  33.55 
 
 
149 aa  65.9  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.108952  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3735  hypothetical protein  30.48 
 
 
135 aa  65.5  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.722442  normal  0.0462573 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1081  hypothetical protein  29.03 
 
 
145 aa  61.6  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.129849 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0415  hypothetical protein  31.09 
 
 
147 aa  60.8  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0438215  hitchhiker  0.000233911 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1867  hypothetical protein  33.61 
 
 
174 aa  59.3  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000073  hypothetical protein  31.45 
 
 
146 aa  52.4  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5640  hypothetical protein  32.48 
 
 
177 aa  52  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00146587  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3971  hypothetical protein  38.55 
 
 
153 aa  51.2  0.000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6041  hypothetical protein  24 
 
 
147 aa  50.8  0.000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.970972  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0919  hypothetical protein  30 
 
 
118 aa  49.3  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.404023  normal  0.0701309 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05688  hypothetical protein  25.87 
 
 
146 aa  48.9  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0866  hypothetical protein  23.33 
 
 
153 aa  48.1  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.171288  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2359  hypothetical protein  29.37 
 
 
181 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0847029  normal  0.335248 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1905  hypothetical protein  28.12 
 
 
183 aa  44.3  0.0007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.539779 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3682  hypothetical protein  25.89 
 
 
175 aa  43.1  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.840145  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1032  hypothetical protein  30.28 
 
 
144 aa  43.1  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2301  hypothetical protein  24.6 
 
 
147 aa  43.1  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2661  hypothetical protein  27.36 
 
 
137 aa  42  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.343805  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>