24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_3971 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_3971  hypothetical protein  100 
 
 		 153 aa  303  7e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5640  hypothetical protein  44.06 
 
 		 177 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00146587  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2359  hypothetical protein  39.6 
 
 		 181 aa  101  4e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0847029  normal  0.335248 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1905  hypothetical protein  35.1 
 
 		 183 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.539779 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2001  hypothetical protein  35.1 
 
 		 183 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2396  hypothetical protein  34.64 
 
 		 193 aa  77.8  0.00000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3299  hypothetical protein  34.44 
 
 		 183 aa  77  0.00000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.43455 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1032  hypothetical protein  41.53 
 
 		 144 aa  76.3  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3727  hypothetical protein  31.91 
 
 		 188 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.918767 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0940  hypothetical protein  30.5 
 
 		 155 aa  66.2  0.0000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0606896  hitchhiker  0.00778912 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2190  hypothetical protein  33.61 
 
 		 158 aa  63.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2142  hypothetical protein  33.61 
 
 		 158 aa  63.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3997  hypothetical protein  33.05 
 
 		 161 aa  62  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0934  hypothetical protein  34.75 
 
 		 156 aa  61.6  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000073  hypothetical protein  30.66 
 
 		 146 aa  55.1  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05688  hypothetical protein  31.82 
 
 		 146 aa  51.6  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2245  hypothetical protein  33.9 
 
 		 135 aa  50.4  0.000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.702566  normal  0.472151 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2202  conserved hypothetical protein; putative secreted protein  37.29 
 
 		 135 aa  50.4  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.184904  normal  0.817106 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0919  hypothetical protein  34.94 
 
 		 118 aa  48.1  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.404023  normal  0.0701309 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2903  hypothetical protein  30.95 
 
 		 134 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.203392  normal  0.153041 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2520  hypothetical protein  33.93 
 
 		 135 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.586932  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0383  hypothetical protein  31.97 
 
 		 145 aa  41.2  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00782707 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4456  hypothetical protein  30.51 
 
 		 133 aa  41.2  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00696256 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3735  hypothetical protein  35.14 
 
 		 135 aa  40.8  0.007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.722442  normal  0.0462573 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>