11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_2001 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_2001  hypothetical protein  100 
 
 		 183 aa  354  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3299  hypothetical protein  97.81 
 
 		 183 aa  290  6e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.43455 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2396  hypothetical protein  97.27 
 
 		 193 aa  290  8e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1905  hypothetical protein  97.81 
 
 		 183 aa  289  2e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.539779 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2359  hypothetical protein  55.74 
 
 		 181 aa  180  1e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0847029  normal  0.335248 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5640  hypothetical protein  54.1 
 
 		 177 aa  175  3e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00146587  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3727  hypothetical protein  51.02 
 
 		 188 aa  135  4e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.918767 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1032  hypothetical protein  33.06 
 
 		 144 aa  60.1  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3971  hypothetical protein  31.58 
 
 		 153 aa  60.1  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2142  hypothetical protein  28.97 
 
 		 158 aa  45.4  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2190  hypothetical protein  28.57 
 
 		 158 aa  44.7  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>