48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_1890 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_1890  major facilitator superfamily permease  100 
 
 		 419 aa  818    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000264406 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1917  major facilitator superfamily permease  25.33 
 
 		 426 aa  112  1.0000000000000001e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1296  major facilitator superfamily permease  24.11 
 
 		 409 aa  94.4  4e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0052721  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0232  major facilitator superfamily permease  25.52 
 
 		 405 aa  89  2e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.377561  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2548  major facilitator superfamily permease  24.93 
 
 		 406 aa  81.6  0.00000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21930  major facilitator superfamily MFS_1  23.73 
 
 		 432 aa  64.3  0.000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1523  major facilitator superfamily MFS_1  22.47 
 
 		 409 aa  56.2  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.69618  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2679  major facilitator superfamily MFS_1  23.18 
 
 		 453 aa  53.9  0.000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000322743  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1491  major facilitator transporter  23.67 
 
 		 390 aa  53.1  0.000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.326017  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1445  major facilitator transporter  23.67 
 
 		 390 aa  53.1  0.000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00616907  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0134  hypothetical protein  25.11 
 
 		 281 aa  50.8  0.00004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00520082  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0701  major facilitator superfamily MFS_1  24.32 
 
 		 423 aa  50.4  0.00006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1780  major facilitator superfamily MFS_1  23.27 
 
 		 403 aa  49.3  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.41734  normal  0.860702 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0208  major facilitator superfamily MFS_1  24.91 
 
 		 433 aa  48.5  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2122  major facilitator transporter  23.36 
 
 		 424 aa  47.8  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.74746  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5073  putative transporter  26.45 
 
 		 415 aa  47.8  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0174  putative transporter  26.86 
 
 		 415 aa  47  0.0006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2286  major facilitator transporter  24.52 
 
 		 414 aa  46.6  0.0007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0407537  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2326  major facilitator superfamily MFS_1  23.72 
 
 		 410 aa  46.6  0.0007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5163  transporter  26.45 
 
 		 415 aa  46.6  0.0008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4642  transporter  26.45 
 
 		 415 aa  46.6  0.0008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5040  putative transporter  26.45 
 
 		 415 aa  46.6  0.0008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4800  transporter  26.45 
 
 		 415 aa  46.6  0.0008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4661  transporter  26.45 
 
 		 415 aa  46.6  0.0008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5069  putative transporter  26.45 
 
 		 415 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4750  major facilitator transporter  29.55 
 
 		 415 aa  45.8  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1782  putative permease  23.65 
 
 		 422 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1398  major facilitator transporter  21.07 
 
 		 422 aa  45.1  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.902897  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2514  major facilitator superfamily MFS_1  25.32 
 
 		 439 aa  45.4  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1568  multidrug resistance protein; tetracycline resistance determinant  23.65 
 
 		 422 aa  45.4  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.766892  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3594  putative permease  23.28 
 
 		 422 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3486  major facilitator transporter  25.7 
 
 		 450 aa  44.7  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.719238  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1607  major facilitator transporter  22.41 
 
 		 422 aa  44.7  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0422221  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2572  major facilitator transporter  37.14 
 
 		 358 aa  44.7  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2520  major facilitator transporter  37.14 
 
 		 358 aa  44.7  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1272  major facilitator transporter  23.74 
 
 		 418 aa  44.7  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0918  major facilitator superfamily permease  24.09 
 
 		 402 aa  44.3  0.004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5067  transporter, putative  28.98 
 
 		 415 aa  44.3  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2511  ABC transporter, permease protein, putative  24.93 
 
 		 414 aa  44.3  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00150223  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1559  multidrug resistance protein; tetracycline resistance determinant  23.08 
 
 		 422 aa  43.9  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.285528  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1731  permease  23.2 
 
 		 422 aa  44.3  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1607  permease  23.2 
 
 		 422 aa  44.3  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.137367  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2227  permease; macrolide-efflux protein  24.11 
 
 		 417 aa  43.9  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0120958  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4222  major facilitator transporter  23.5 
 
 		 432 aa  43.9  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.399211  hitchhiker  0.00102981 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2480  ABC transporter permease  25.7 
 
 		 415 aa  43.5  0.007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0926781  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2501  putative ABC transporter, permease protein  25.7 
 
 		 415 aa  43.5  0.008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2305  ABC transporter permease  25.7 
 
 		 417 aa  43.5  0.008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0193471  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2273  permease; macrolide-efflux protein  25.7 
 
 		 417 aa  43.1  0.01  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00046211  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>