19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_1917 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_1917  major facilitator superfamily permease  100 
 
 
426 aa  843    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0232  major facilitator superfamily permease  24.43 
 
 
405 aa  140  3e-32  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.377561  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1296  major facilitator superfamily permease  29.34 
 
 
409 aa  128  2.0000000000000002e-28  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0052721  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2548  major facilitator superfamily permease  26.75 
 
 
406 aa  127  4.0000000000000003e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1890  major facilitator superfamily permease  25.33 
 
 
419 aa  115  1.0000000000000001e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000264406 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2654  macrolide efflux protein, putative  23.9 
 
 
414 aa  48.9  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1539  major facilitator transporter  23.36 
 
 
412 aa  48.5  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000151531  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1538  major facilitator transporter  20.67 
 
 
404 aa  48.1  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.756552  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0427  transporter, putative  21.74 
 
 
412 aa  47.4  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1808  permease, putative  20.1 
 
 
422 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1782  putative permease  19.25 
 
 
422 aa  46.6  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1559  multidrug resistance protein; tetracycline resistance determinant  19.25 
 
 
422 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.285528  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1568  multidrug resistance protein; tetracycline resistance determinant  20.34 
 
 
422 aa  46.2  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.766892  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0692  major facilitator transporter  21.22 
 
 
439 aa  45.8  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1731  permease  19.25 
 
 
422 aa  45.8  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1607  permease  19.25 
 
 
422 aa  45.8  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.137367  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1861  major facilitator transporter  23.25 
 
 
413 aa  45.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0051281 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1559  major facilitator transporter  22.54 
 
 
412 aa  43.1  0.01  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000341731  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1323  major facilitator superfamily MFS_1  19.64 
 
 
429 aa  43.1  0.01  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.107888  normal  0.120407 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>