25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_1499 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008530  LGAS_1499  hypothetical protein  100 
 
 
185 aa  363  1e-100  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.494823  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2766  hypothetical protein  56.28 
 
 
184 aa  222  2e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.302276  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2709  hypothetical protein  56.28 
 
 
184 aa  222  2e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1836  hypothetical protein  55.74 
 
 
185 aa  217  7.999999999999999e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1556  hypothetical protein  54.64 
 
 
185 aa  216  2e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0381762  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1974  hypothetical protein  58.15 
 
 
187 aa  213  9e-55  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.352822  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0367  hypothetical protein  53.04 
 
 
188 aa  197  7.999999999999999e-50  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1634  hypothetical protein  52.81 
 
 
212 aa  191  4e-48  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00356252  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07640  predicted membrane protein  48.02 
 
 
184 aa  149  2e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.532063  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0346  hypothetical protein  40.88 
 
 
181 aa  148  5e-35  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001243  substrate-specific component MtsA of methionine-regulated ECF transporter  38.59 
 
 
182 aa  100  9e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05109  hypothetical protein  37.5 
 
 
182 aa  97.4  9e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1988  hypothetical protein  35.87 
 
 
183 aa  92  4e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0978755  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2500  hypothetical protein  32.98 
 
 
182 aa  86.3  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00984569  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2659  hypothetical protein  34.04 
 
 
182 aa  87  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.407777  hitchhiker  0.00000362909 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2665  hypothetical protein  34.04 
 
 
182 aa  85.9  3e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.907427  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2384  hypothetical protein  33.51 
 
 
182 aa  85.1  5e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.628476  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2667  hypothetical protein  33.51 
 
 
182 aa  84.3  8e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00757305  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2708  hypothetical protein  32.98 
 
 
182 aa  83.2  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2657  hypothetical protein  32.09 
 
 
182 aa  82.8  0.000000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000063356 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2640  hypothetical protein  31.91 
 
 
182 aa  82.4  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2460  hypothetical protein  31.91 
 
 
182 aa  82.4  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0258676  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2423  hypothetical protein  31.91 
 
 
182 aa  81.6  0.000000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000315162  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1534  hypothetical protein  29.41 
 
 
191 aa  45.8  0.0004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.204785  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8787  hypothetical protein  27.59 
 
 
187 aa  43.9  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>