24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1556 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008262  CPR_1556  hypothetical protein  100 
 
 		 185 aa  359  1e-98  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0381762  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1836  hypothetical protein  96.22 
 
 		 185 aa  352  2e-96  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2766  hypothetical protein  56.52 
 
 		 184 aa  220  8e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.302276  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2709  hypothetical protein  56.52 
 
 		 184 aa  220  8e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1499  hypothetical protein  54.64 
 
 		 185 aa  216  2e-55  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.494823  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0367  hypothetical protein  53.37 
 
 		 188 aa  197  7.999999999999999e-50  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1974  hypothetical protein  48.09 
 
 		 187 aa  185  3e-46  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.352822  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1634  hypothetical protein  50.28 
 
 		 212 aa  182  2.0000000000000003e-45  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00356252  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07640  predicted membrane protein  45.65 
 
 		 184 aa  154  9e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.532063  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0346  hypothetical protein  38.59 
 
 		 181 aa  132  3e-30  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1988  hypothetical protein  36.56 
 
 		 183 aa  106  2e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0978755  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001243  substrate-specific component MtsA of methionine-regulated ECF transporter  36.56 
 
 		 182 aa  103  1e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05109  hypothetical protein  36.02 
 
 		 182 aa  102  3e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2500  hypothetical protein  34.78 
 
 		 182 aa  95.5  4e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00984569  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2657  hypothetical protein  36.07 
 
 		 182 aa  95.1  5e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000063356 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2640  hypothetical protein  35.87 
 
 		 182 aa  94.7  6e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2460  hypothetical protein  35.87 
 
 		 182 aa  94.7  6e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0258676  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2384  hypothetical protein  35.87 
 
 		 182 aa  93.2  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.628476  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2423  hypothetical protein  35.33 
 
 		 182 aa  93.2  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000315162  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2667  hypothetical protein  35.33 
 
 		 182 aa  92.8  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00757305  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2708  hypothetical protein  35.33 
 
 		 182 aa  92.4  3e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2659  hypothetical protein  35.87 
 
 		 182 aa  92.8  3e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.407777  hitchhiker  0.00000362909 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2665  hypothetical protein  35.87 
 
 		 182 aa  92  5e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.907427  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8787  hypothetical protein  26.19 
 
 		 187 aa  44.7  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>