24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1836 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_1836  hypothetical protein  100 
 
 		 185 aa  360  6e-99  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1556  hypothetical protein  96.22 
 
 		 185 aa  352  2e-96  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0381762  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2766  hypothetical protein  57.61 
 
 		 184 aa  223  9e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.302276  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2709  hypothetical protein  57.61 
 
 		 184 aa  223  9e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1499  hypothetical protein  55.74 
 
 		 185 aa  217  7.999999999999999e-56  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.494823  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0367  hypothetical protein  54.49 
 
 		 188 aa  199  1.9999999999999998e-50  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1634  hypothetical protein  51.93 
 
 		 212 aa  189  2.9999999999999997e-47  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00356252  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1974  hypothetical protein  49.18 
 
 		 187 aa  188  4e-47  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.352822  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07640  predicted membrane protein  47.28 
 
 		 184 aa  156  2e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.532063  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0346  hypothetical protein  40.22 
 
 		 181 aa  135  3.0000000000000003e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1988  hypothetical protein  38.92 
 
 		 183 aa  109  2.0000000000000002e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0978755  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001243  substrate-specific component MtsA of methionine-regulated ECF transporter  37.84 
 
 		 182 aa  106  2e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05109  hypothetical protein  37.3 
 
 		 182 aa  104  6e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2500  hypothetical protein  34.24 
 
 		 182 aa  93.2  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00984569  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2640  hypothetical protein  35.33 
 
 		 182 aa  92.8  3e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2460  hypothetical protein  35.33 
 
 		 182 aa  92.8  3e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0258676  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2657  hypothetical protein  35.52 
 
 		 182 aa  92.8  3e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000063356 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2384  hypothetical protein  35.33 
 
 		 182 aa  90.9  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.628476  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2659  hypothetical protein  35.33 
 
 		 182 aa  90.5  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.407777  hitchhiker  0.00000362909 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2667  hypothetical protein  34.78 
 
 		 182 aa  90.5  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00757305  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2423  hypothetical protein  34.78 
 
 		 182 aa  90.9  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000315162  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2665  hypothetical protein  35.33 
 
 		 182 aa  89.7  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.907427  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2708  hypothetical protein  34.78 
 
 		 182 aa  90.1  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8787  hypothetical protein  30.49 
 
 		 187 aa  43.5  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>