92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_1023 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008527  LACR_1023  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  100 
 
 
248 aa  511  1e-144  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00187216  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0159  D-alanyl-D-alanine-carboxypeptidase  54.07 
 
 
265 aa  254  1.0000000000000001e-66  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0638016  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0093  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  50.59 
 
 
250 aa  238  5e-62  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.51326  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0292  M15B family D-Ala-D-Ala carboxypeptidase VanY  41.82 
 
 
257 aa  160  2e-38  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3005  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  34.15 
 
 
243 aa  126  3e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.014963  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1065  M15B family D-Ala-D-Ala carboxypeptidase VanY  38.46 
 
 
219 aa  124  1e-27  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1934  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  34.58 
 
 
239 aa  123  3e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.3783  normal  0.159491 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3298  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  34.84 
 
 
243 aa  122  4e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05720  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  32.4 
 
 
275 aa  115  6.9999999999999995e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.435379  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1899  M15B family D-Ala-D-Ala carboxypeptidase VanY  30.32 
 
 
289 aa  104  2e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1862  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  29.43 
 
 
281 aa  97.1  2e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.018097  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3213  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  35.47 
 
 
259 aa  94.7  1e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3126  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  29.32 
 
 
248 aa  94.7  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.17316  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2421  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  37.59 
 
 
273 aa  92.8  4e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1686  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  27.37 
 
 
247 aa  92  7e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000186356  hitchhiker  5.41079e-16 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2349  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  28.04 
 
 
243 aa  90.5  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.732241  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2526  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  28.04 
 
 
243 aa  90.5  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.080639  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2541  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  28.04 
 
 
243 aa  90.1  3e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.35548e-47 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2266  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  28.04 
 
 
243 aa  89  6e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0349976  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0633  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase, putative  36.13 
 
 
266 aa  88.2  1e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4622  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  34.59 
 
 
259 aa  87  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4758  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  29.06 
 
 
241 aa  87.8  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.333329  normal  0.0265584 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4642  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  34.59 
 
 
259 aa  87  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.218213  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4342  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  33.96 
 
 
259 aa  87  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0613  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  34.59 
 
 
259 aa  86.3  4e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2308  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  31.98 
 
 
173 aa  85.1  8e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000166242  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4641  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  33.96 
 
 
259 aa  85.1  9e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4261  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  33.96 
 
 
259 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4750  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  33.96 
 
 
259 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4410  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  33.96 
 
 
259 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4249  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  33.96 
 
 
259 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4626  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  33.96 
 
 
259 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1875  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  28.46 
 
 
246 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1919  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  26.64 
 
 
246 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.345839  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2169  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  26.87 
 
 
246 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.742674  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2101  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  28.46 
 
 
246 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2141  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  26.87 
 
 
246 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0859395  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4978  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  27.82 
 
 
286 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1923  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  28.46 
 
 
246 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.499813  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2070  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  28.46 
 
 
246 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1631  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  31.29 
 
 
263 aa  80.5  0.00000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.303902  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1885  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  28.46 
 
 
246 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.699634  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4581  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  43.82 
 
 
286 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5008  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  29.45 
 
 
286 aa  80.1  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2059  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  27.82 
 
 
246 aa  80.1  0.00000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0118703  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1371  carboxypeptidase-like protein  30.67 
 
 
263 aa  80.5  0.00000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.919342  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0259  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  30.2 
 
 
286 aa  79.7  0.00000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0170483  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1557  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  43.48 
 
 
246 aa  79.7  0.00000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.260228  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4961  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  42.7 
 
 
286 aa  79  0.00000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5104  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  42.7 
 
 
286 aa  79  0.00000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4743  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  42.7 
 
 
286 aa  79  0.00000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4690  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  42.7 
 
 
286 aa  78.6  0.00000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4989  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  42.7 
 
 
286 aa  79  0.00000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3249  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  32.35 
 
 
246 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000420976  normal  0.257311 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17500  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  29.5 
 
 
273 aa  77.8  0.0000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.050833  normal  0.192167 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4603  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  41.57 
 
 
286 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.336858  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2623  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  36.62 
 
 
286 aa  77  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.42366 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2914  M15B family D-Ala-D-Ala carboxypeptidase VanY  37.32 
 
 
299 aa  77.8  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.864232  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1388  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  30.96 
 
 
291 aa  75.5  0.0000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.423501  normal  0.023424 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1721  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  34.27 
 
 
321 aa  75.1  0.0000000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.000495167  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3932  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  30.67 
 
 
264 aa  74.7  0.000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0495  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  41.18 
 
 
332 aa  72.8  0.000000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.798346  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2970  peptidase M15B and M15C, D,D-carboxypeptidase VanY/endolysins  36.36 
 
 
272 aa  72  0.000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1241  putative carboxypeptidase  29.66 
 
 
250 aa  70.9  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.747447 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2250  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  33.58 
 
 
303 aa  68.9  0.00000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0294681  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3580  M15B family D-Ala-D-Ala carboxypeptidase VanY  28.57 
 
 
269 aa  68.6  0.00000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0106036 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16800  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  31.25 
 
 
217 aa  67.8  0.0000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.690587  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0165  M15B family D-Ala-D-Ala carboxypeptidase VanY  28.93 
 
 
236 aa  66.6  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.132587  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1238  putative carboxypeptidase  32.03 
 
 
267 aa  65.1  0.000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.588362  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07971  putative carboxypeptidase  28.44 
 
 
210 aa  63.5  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.999242 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2914  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  30.41 
 
 
263 aa  63.2  0.000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.333526  normal  0.295776 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18330  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  32.26 
 
 
357 aa  62  0.000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0595  putative carboxypeptidase  26.13 
 
 
262 aa  62  0.000000009  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.394484  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16751  putative carboxypeptidase  34.15 
 
 
243 aa  61.6  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.57594 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1672  M15B family D-Ala-D-Ala carboxypeptidase VanY  29.38 
 
 
241 aa  60.1  0.00000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1196  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  31.18 
 
 
244 aa  58.9  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.206054 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08221  putative carboxypeptidase  33.6 
 
 
243 aa  58.5  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4445  M15B family D-Ala-D-Ala carboxypeptidase VanY  32.85 
 
 
284 aa  57  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.585911  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10021  putative carboxypeptidase  28.66 
 
 
248 aa  56.2  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.127155 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3270  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  33.52 
 
 
246 aa  55.8  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.885024  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2828  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  34.16 
 
 
246 aa  55.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3438  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  30.58 
 
 
246 aa  52.4  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000425893 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08231  putative carboxypeptidase  31.2 
 
 
237 aa  52  0.00001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08211  putative carboxypeptidase  30.33 
 
 
182 aa  50.4  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0769  putative carboxypeptidase  30.4 
 
 
237 aa  50.1  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1968  peptidase  27.35 
 
 
187 aa  48.5  0.00009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1735  VanY family protein  22.93 
 
 
224 aa  47.8  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1902  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  27.35 
 
 
202 aa  48.5  0.0001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2376  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  28.45 
 
 
222 aa  43.9  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1764  peptidase M15B and M15C, D,D-carboxypeptidase VanY/endolysins  22.4 
 
 
236 aa  42.7  0.005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.357856  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2419  peptidase M15B and M15C, D,D-carboxypeptidase VanY/endolysin  22.86 
 
 
225 aa  42.4  0.006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.128484  decreased coverage  0.00000107328 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04455  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family  27.74 
 
 
265 aa  42.4  0.007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>