34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2552 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_2552  plasmid encoded RepA protein  100 
 
 		 290 aa  584  1e-166  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2333  plasmid encoded RepA protein  87.37 
 
 		 280 aa  503  1e-141  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3841  plasmid encoded RepA protein  35.17 
 
 		 288 aa  169  6e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2495  plasmid encoded RepA protein  81.11 
 
 		 103 aa  150  3e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2825  plasmid encoded RepA protein  33.68 
 
 		 329 aa  139  7.999999999999999e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6304  plasmid encoded RepA protein  34.88 
 
 		 418 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007515  Gmet_A3565  hypothetical protein  28.47 
 
 		 366 aa  115  6.9999999999999995e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.539366  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0001  REPA replicase protein  29.51 
 
 		 341 aa  112  6e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000644279  normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2404  plasmid encoded RepA protein  40.26 
 
 		 274 aa  108  1e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3894  plasmid encoded RepA protein  45.87 
 
 		 357 aa  95.1  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3781  plasmid encoded RepA protein  45.87 
 
 		 357 aa  95.1  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.407659  normal  0.193464 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5817  replicase protein  44.95 
 
 		 364 aa  91.7  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5341  plasmid encoded RepA protein  44.95 
 
 		 364 aa  92  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.921564  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2879  plasmid encoded RepA protein  28.01 
 
 		 295 aa  87.4  2e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0838  plasmid encoded RepA protein  37.1 
 
 		 302 aa  82.4  0.000000000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.453567 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0392  plasmid encoded RepA protein  39.47 
 
 		 299 aa  82.4  0.000000000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3681  plasmid encoded RepA protein  39.29 
 
 		 370 aa  82  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.936981  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5077  plasmid encoded RepA protein  38.39 
 
 		 334 aa  81.3  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0739212 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0029  plasmid encoded RepA protein  42.2 
 
 		 328 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5948  plasmid encoded RepA protein  28.06 
 
 		 358 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.087033  normal  0.0313966 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6551  plasmid encoded RepA protein  24 
 
 		 359 aa  75.9  0.0000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.126036  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4956  plasmid encoded RepA protein  24.91 
 
 		 434 aa  75.1  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3919  plasmid encoded RepA protein  24.55 
 
 		 434 aa  73.6  0.000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2261  plasmid encoded RepA protein  35.96 
 
 		 303 aa  72  0.00000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000207184  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3440  plasmid encoded RepA protein  36.36 
 
 		 311 aa  70.9  0.00000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.246282  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2732  hypothetical protein  59.32 
 
 		 111 aa  69.3  0.00000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.253295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2651  plasmid encoded RepA protein  35.71 
 
 		 282 aa  68.9  0.00000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00773036  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3914  plasmid encoded RepA protein  31.82 
 
 		 365 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0766872 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4387  plasmid encoded RepA protein  31.82 
 
 		 362 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4282  plasmid encoded RepA protein  31.82 
 
 		 365 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.163535 
 
 
-
 
NC_004252  pDOJH10L_p05  replicase  35.85 
 
 		 352 aa  65.1  0.000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1558  plasmid encoded RepA protein  33.33 
 
 		 364 aa  62  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.881122  normal  0.10622 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2376  plasmid encoded RepA protein  31.65 
 
 		 350 aa  53.1  0.000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00013928 
 
 
-
 
NC_013733  Slin_7007  plasmid encoded RepA protein  29.13 
 
 		 309 aa  50.8  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.543469  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>