20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2495 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_2495  plasmid encoded RepA protein  100 
 
 		 103 aa  216  1e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2552  plasmid encoded RepA protein  81.11 
 
 		 290 aa  149  1e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2333  plasmid encoded RepA protein  82.95 
 
 		 280 aa  149  1e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3841  plasmid encoded RepA protein  40.91 
 
 		 288 aa  70.5  0.000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6304  plasmid encoded RepA protein  43.04 
 
 		 418 aa  63.9  0.0000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2404  plasmid encoded RepA protein  40.51 
 
 		 274 aa  59.3  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0029  plasmid encoded RepA protein  39.24 
 
 		 328 aa  53.1  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007515  Gmet_A3565  hypothetical protein  34.52 
 
 		 366 aa  52  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.539366  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0392  plasmid encoded RepA protein  35.44 
 
 		 299 aa  51.2  0.000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5341  plasmid encoded RepA protein  39.68 
 
 		 364 aa  49.7  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.921564  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5817  replicase protein  39.68 
 
 		 364 aa  49.7  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2825  plasmid encoded RepA protein  29.76 
 
 		 329 aa  48.5  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3781  plasmid encoded RepA protein  39.68 
 
 		 357 aa  48.5  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.407659  normal  0.193464 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3894  plasmid encoded RepA protein  39.68 
 
 		 357 aa  48.5  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2732  hypothetical protein  51.06 
 
 		 111 aa  48.1  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.253295  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0001  REPA replicase protein  39.68 
 
 		 341 aa  48.1  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000644279  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5077  plasmid encoded RepA protein  35.71 
 
 		 334 aa  47.8  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0739212 
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2261  plasmid encoded RepA protein  32.91 
 
 		 303 aa  45.4  0.0002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000207184  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3681  plasmid encoded RepA protein  40.35 
 
 		 370 aa  44.7  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.936981  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2712  regulatory protein, MerR  32.98 
 
 		 246 aa  40.8  0.006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.120713  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>