22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2450 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_2450  peptidase S26B, signal peptidase  100 
 
 
230 aa  454  1e-127  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3518  peptidase S26B, signal peptidase  50.88 
 
 
185 aa  151  8e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00808654  normal  0.222242 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0663  peptidase S26B, signal peptidase  44.16 
 
 
178 aa  125  5e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17050  signal peptidase I  38.22 
 
 
232 aa  100  2e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0856146  normal  0.95048 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5563  Peptidase S24/S26A/S26B, conserved region  40.43 
 
 
300 aa  59.7  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.425779  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2281  signal peptidase I  33.07 
 
 
166 aa  55.8  0.0000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0493  signal peptidase I  35.83 
 
 
174 aa  55.8  0.0000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0480  peptidase, putative  34.17 
 
 
166 aa  54.3  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2579  signal peptidase I  30.71 
 
 
166 aa  51.6  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.767208  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1312  peptidase S26B, signal peptidase  29.17 
 
 
179 aa  50.4  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4237  peptidase S26B, signal peptidase  35.21 
 
 
185 aa  48.9  0.00007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.431986  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0128  peptidase S26B, signal peptidase  33.13 
 
 
353 aa  47.4  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2961  signal peptidase SipW  30.83 
 
 
270 aa  47.8  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2637  peptidase S26B, signal peptidase  46.67 
 
 
207 aa  46.6  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4390  peptidase S26B, signal peptidase  35.54 
 
 
420 aa  45.8  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0663  peptidase S26B, signal peptidase  37.74 
 
 
618 aa  45.4  0.0007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.10738  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2844  peptidase S26B, signal peptidase  29.93 
 
 
217 aa  45.4  0.0008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0999  peptidase S26B, signal peptidase  29.91 
 
 
191 aa  44.7  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00791277  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2922  peptidase S26B, signal peptidase  37.8 
 
 
218 aa  44.7  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2206  peptidase S26B, signal peptidase  30 
 
 
309 aa  43.1  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1329  signal peptidase I  26.47 
 
 
189 aa  41.6  0.01  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.991383  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4034  peptidase S26B, signal peptidase  35.53 
 
 
216 aa  41.6  0.01  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0285496 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>