85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0021 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_0021  NrdI protein  100 
 
 		 145 aa  296  8e-80  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.550333 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0140  NrdI protein  65.96 
 
 		 141 aa  192  1e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.570583 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0355  ribonucleotide reductase stimulatory protein  35.71 
 
 		 130 aa  92  2e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1009  NrdI protein  38.89 
 
 		 136 aa  86.3  1e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.413651  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02494  hypothetical protein  38.89 
 
 		 136 aa  86.3  1e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3918  ribonucleotide reductase stimulatory protein  38.89 
 
 		 136 aa  86.3  1e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0782366 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3205  ribonucleotide reductase stimulatory protein  38.89 
 
 		 136 aa  86.3  1e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2796  ribonucleotide reductase stimulatory protein  38.89 
 
 		 136 aa  86.3  1e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0122492 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1032  ribonucleotide reductase stimulatory protein  38.89 
 
 		 136 aa  86.3  1e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02530  hypothetical protein  38.89 
 
 		 136 aa  86.3  1e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2810  ribonucleotide reductase stimulatory protein  38.89 
 
 		 136 aa  86.3  1e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4376  ribonucleotide reductase stimulatory protein  38.28 
 
 		 138 aa  85.1  3e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.526364 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2955  ribonucleotide reductase stimulatory protein  37.88 
 
 		 136 aa  84.7  4e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2954  ribonucleotide reductase stimulatory protein  36.51 
 
 		 136 aa  84.3  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0571032  normal  0.0132689 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2923  ribonucleotide reductase stimulatory protein  36.51 
 
 		 136 aa  84.3  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3112  ribonucleotide reductase stimulatory protein  36.51 
 
 		 136 aa  84.3  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.639432  normal  0.48077 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3154  ribonucleotide reductase stimulatory protein  38.28 
 
 		 136 aa  84.3  5e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00169031  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2989  ribonucleotide reductase stimulatory protein  36.51 
 
 		 136 aa  84.3  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0715726 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3006  ribonucleotide reductase stimulatory protein  36.51 
 
 		 136 aa  84  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00316794 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0315  ribonucleotide reductase stimulatory protein  36.57 
 
 		 135 aa  83.6  8e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.560597  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0291  ribonucleotide reductase stimulatory protein  36.57 
 
 		 135 aa  83.6  8e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0933755  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0520  ribonucleotide reductase stimulatory protein  36.36 
 
 		 140 aa  80.5  0.000000000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.295884  normal  0.147892 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0804  NrdI protein  40.77 
 
 		 132 aa  80.5  0.000000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.861092 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3722  ribonucleotide reductase stimulatory protein  37.7 
 
 		 134 aa  80.5  0.000000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.667142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24920  ribonucleoside-diphosphate reductase 2, operon protein nrdI  37.6 
 
 		 132 aa  77.8  0.00000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.580966  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0378  nrdI protein  37.3 
 
 		 134 aa  77.8  0.00000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3132  ribonucleotide reductase stimulatory protein  34.38 
 
 		 135 aa  76.6  0.00000000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1013  NrdI protein  34.88 
 
 		 136 aa  76.3  0.0000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.890244  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1147  ribonucleotide reductase stimulatory protein  34.38 
 
 		 135 aa  76.3  0.0000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.874244  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10190  ribonucleoside-diphosphate reductase 2, operon protein nrdI  40 
 
 		 138 aa  75.5  0.0000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.64466  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2357  NrdI protein  35.94 
 
 		 162 aa  74.3  0.0000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.248989  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2118  NrdI protein  35.82 
 
 		 156 aa  73.9  0.0000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000515872 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0419  ribonucleotide reductase stimulatory protein  35.04 
 
 		 137 aa  73.9  0.0000000000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0680804  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28110  ribonucleoside-diphosphate reductase 2, operon protein nrdI  35.16 
 
 		 169 aa  73.6  0.000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0178  NrdI protein  43.75 
 
 		 166 aa  73.2  0.000000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl529  ribonucleotide reductase stimulatory protein  31.54 
 
 		 151 aa  72.4  0.000000000002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2953  ribonucleotide reductase stimulatory protein  32.09 
 
 		 135 aa  72  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0447  NrdI protein  38.02 
 
 		 138 aa  72.4  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3794  ribonucleotide reductase stimulatory protein  32.56 
 
 		 137 aa  72.8  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10480  ribonucleoside-diphosphate reductase 2, operon protein nrdI  34.38 
 
 		 155 aa  72  0.000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00520906  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1064  ribonucleotide reductase stimulatory protein  35.25 
 
 		 134 aa  71.2  0.000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0396563  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3539  ribonucleotide reductase stimulatory protein  35.25 
 
 		 141 aa  71.2  0.000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00692175  hitchhiker  0.00976656 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1118  ribonucleotide reductase stimulatory protein  35.25 
 
 		 134 aa  71.2  0.000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1461  ribonucleotide reductase stimulatory protein  41.86 
 
 		 152 aa  71.2  0.000000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3499  ribonucleotide reductase stimulatory protein  32.56 
 
 		 134 aa  70.1  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.672215 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2438  NrdI protein  40.7 
 
 		 143 aa  70.1  0.00000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.223638  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0970  NrdI protein  36.29 
 
 		 126 aa  68.9  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1942  flavoprotein NrdI  30.77 
 
 		 151 aa  68.6  0.00000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.966065  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0100  ribonucleotide reductase stimulatory protein  34.4 
 
 		 157 aa  68.6  0.00000000003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0199  flavoprotein NrdI  37.93 
 
 		 152 aa  68.6  0.00000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.155781  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2041  ribonucleotide reductase stimulatory protein  34.07 
 
 		 152 aa  68.2  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.692701 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2970  NrdI protein  34.06 
 
 		 154 aa  68.2  0.00000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.53176  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7386  ribonucleotide reductase stimulatory protein  32.03 
 
 		 138 aa  67.8  0.00000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.320547  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13068  ribonucleotide reductase stimulatory protein  34.09 
 
 		 150 aa  67.4  0.00000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.151706 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3290  NrdI protein  33.07 
 
 		 156 aa  67  0.00000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0396  ribonucleotide reductase stimulatory protein  32 
 
 		 132 aa  66.6  0.0000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1241  ribonucleotide reductase stimulatory protein  36.84 
 
 		 119 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.858034  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1369  ribonucleotide reductase stimulatory protein  36.84 
 
 		 119 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0335338  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1062  ribonucleotide reductase stimulatory protein  30 
 
 		 140 aa  65.5  0.0000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000562728  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1469  ribonucleotide reductase stimulatory protein  36.84 
 
 		 119 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0534212  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1266  ribonucleotide reductase stimulatory protein  36.84 
 
 		 119 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.503545  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1239  ribonucleotide reductase stimulatory protein  36.84 
 
 		 119 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.316696  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1440  ribonucleotide reductase stimulatory protein  36.84 
 
 		 119 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000010796 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1508  ribonucleotide reductase stimulatory protein  36.84 
 
 		 119 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000012533  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4306  ribonucleotide reductase stimulatory protein  31.82 
 
 		 148 aa  64.3  0.0000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0096  NrdI protein  34.43 
 
 		 138 aa  63.9  0.0000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.491931  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4459  NrdI protein  31.72 
 
 		 144 aa  63.9  0.0000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000523817 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1515  nrdI protein  32.58 
 
 		 137 aa  62.8  0.000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000118726  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1404  ribonucleotide reductase stimulatory protein  35.96 
 
 		 119 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00373204  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3939  ribonucleotide reductase stimulatory protein  35.96 
 
 		 119 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00138994  normal  0.102408 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1863  ribonucleotide reductase stimulatory protein  31.85 
 
 		 152 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.159531 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1267  ribonucleotide reductase stimulatory protein  35.96 
 
 		 119 aa  62.8  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.129347  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1797  ribonucleotide reductase stimulatory protein  31.85 
 
 		 152 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.131546  normal  0.93633 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1816  ribonucleotide reductase stimulatory protein  31.85 
 
 		 152 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.580222  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1704  ribonucleotide reductase stimulatory protein  28.78 
 
 		 153 aa  62.8  0.000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0804489  hitchhiker  0.00000000216411 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1073  ribonucleotide reductase stimulatory protein  36.84 
 
 		 119 aa  62  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.882937  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0924  NrdI family protein  28.36 
 
 		 158 aa  55.1  0.0000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0754  ribonucleotide reductase stimulatory protein  29.6 
 
 		 132 aa  54.3  0.0000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.493486  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0771  ribonucleotide reductase stimulatory protein  29.6 
 
 		 132 aa  54.3  0.0000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0138  ribonucleotide reduction protein  27.27 
 
 		 155 aa  52.8  0.000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1762  NrdI family protein  29.46 
 
 		 155 aa  52.8  0.000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2766  NrdI protein  27.91 
 
 		 122 aa  50.1  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0192  ribonucleotide reductase stimulatory protein  39.29 
 
 		 118 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.171913  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0540  NrdI protein  24.6 
 
 		 133 aa  43.5  0.0009  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0255  ribonucleotide reduction protein  26.09 
 
 		 146 aa  40.4  0.008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>