84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_2041 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_2041  ribonucleotide reductase stimulatory protein  100 
 
 
152 aa  317  3e-86  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.692701 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4306  ribonucleotide reductase stimulatory protein  86.09 
 
 
148 aa  272  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1797  ribonucleotide reductase stimulatory protein  83.97 
 
 
152 aa  262  1e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.131546  normal  0.93633 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1863  ribonucleotide reductase stimulatory protein  83.97 
 
 
152 aa  262  1e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.159531 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1816  ribonucleotide reductase stimulatory protein  83.97 
 
 
152 aa  262  1e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.580222  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13068  ribonucleotide reductase stimulatory protein  78 
 
 
150 aa  238  2e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.151706 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2970  NrdI protein  69.63 
 
 
154 aa  185  2e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.53176  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1032  ribonucleotide reductase stimulatory protein  63.97 
 
 
136 aa  184  4e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2810  ribonucleotide reductase stimulatory protein  63.97 
 
 
136 aa  184  4e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02530  hypothetical protein  63.97 
 
 
136 aa  184  4e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2796  ribonucleotide reductase stimulatory protein  63.97 
 
 
136 aa  184  4e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0122492 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3205  ribonucleotide reductase stimulatory protein  63.97 
 
 
136 aa  184  4e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3918  ribonucleotide reductase stimulatory protein  63.97 
 
 
136 aa  184  4e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0782366 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02494  hypothetical protein  63.97 
 
 
136 aa  184  4e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1009  NrdI protein  63.97 
 
 
136 aa  184  4e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.413651  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2955  ribonucleotide reductase stimulatory protein  63.24 
 
 
136 aa  182  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2989  ribonucleotide reductase stimulatory protein  63.97 
 
 
136 aa  179  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0715726 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2954  ribonucleotide reductase stimulatory protein  63.97 
 
 
136 aa  179  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0571032  normal  0.0132689 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2923  ribonucleotide reductase stimulatory protein  63.97 
 
 
136 aa  179  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10190  ribonucleoside-diphosphate reductase 2, operon protein nrdI  64.96 
 
 
138 aa  179  1e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.64466  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3290  NrdI protein  71.54 
 
 
156 aa  177  2.9999999999999997e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3112  ribonucleotide reductase stimulatory protein  63.24 
 
 
136 aa  177  4e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.639432  normal  0.48077 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3006  ribonucleotide reductase stimulatory protein  63.24 
 
 
136 aa  177  4.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00316794 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3154  ribonucleotide reductase stimulatory protein  64.71 
 
 
136 aa  176  2e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00169031  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3722  ribonucleotide reductase stimulatory protein  63.5 
 
 
134 aa  174  3e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.667142  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3539  ribonucleotide reductase stimulatory protein  62.77 
 
 
141 aa  171  5e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00692175  hitchhiker  0.00976656 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1118  ribonucleotide reductase stimulatory protein  62.77 
 
 
134 aa  171  5e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1064  ribonucleotide reductase stimulatory protein  62.77 
 
 
134 aa  171  5e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0396563  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3132  ribonucleotide reductase stimulatory protein  59.85 
 
 
135 aa  170  7.999999999999999e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1147  ribonucleotide reductase stimulatory protein  59.85 
 
 
135 aa  169  1e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.874244  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0447  NrdI protein  62.04 
 
 
138 aa  169  1e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0096  NrdI protein  62.04 
 
 
138 aa  163  9e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.491931  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0291  ribonucleotide reductase stimulatory protein  61.03 
 
 
135 aa  162  2.0000000000000002e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0933755  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0315  ribonucleotide reductase stimulatory protein  61.03 
 
 
135 aa  162  2.0000000000000002e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.560597  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2953  ribonucleotide reductase stimulatory protein  59.85 
 
 
135 aa  161  3e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24920  ribonucleoside-diphosphate reductase 2, operon protein nrdI  59.85 
 
 
132 aa  159  2e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.580966  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2438  NrdI protein  61.97 
 
 
143 aa  157  4e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.223638  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28110  ribonucleoside-diphosphate reductase 2, operon protein nrdI  57.34 
 
 
169 aa  157  5e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2357  NrdI protein  57.34 
 
 
162 aa  155  2e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.248989  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7386  ribonucleotide reductase stimulatory protein  58.39 
 
 
138 aa  154  4e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.320547  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3499  ribonucleotide reductase stimulatory protein  57.35 
 
 
134 aa  150  4e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.672215 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3794  ribonucleotide reductase stimulatory protein  56.62 
 
 
137 aa  150  4e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1013  NrdI protein  56.93 
 
 
136 aa  150  8.999999999999999e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.890244  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0100  ribonucleotide reductase stimulatory protein  54.29 
 
 
157 aa  147  6e-35  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4459  NrdI protein  57.78 
 
 
144 aa  146  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000523817 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0804  NrdI protein  62.12 
 
 
132 aa  144  3e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.861092 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2118  NrdI protein  53.15 
 
 
156 aa  144  6e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000515872 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0520  ribonucleotide reductase stimulatory protein  52.08 
 
 
140 aa  142  1e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.295884  normal  0.147892 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl529  ribonucleotide reductase stimulatory protein  53.38 
 
 
151 aa  141  2e-33  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4376  ribonucleotide reductase stimulatory protein  55.47 
 
 
138 aa  140  4e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.526364 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10480  ribonucleoside-diphosphate reductase 2, operon protein nrdI  56.12 
 
 
155 aa  138  1.9999999999999998e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00520906  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0378  nrdI protein  55.4 
 
 
134 aa  138  3e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1461  ribonucleotide reductase stimulatory protein  51.06 
 
 
152 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0419  ribonucleotide reductase stimulatory protein  50.36 
 
 
137 aa  129  1.0000000000000001e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0680804  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0178  NrdI protein  45.21 
 
 
166 aa  127  7.000000000000001e-29  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0355  ribonucleotide reductase stimulatory protein  46.67 
 
 
130 aa  114  3e-25  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0140  NrdI protein  36.92 
 
 
141 aa  79.7  0.00000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.570583 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0970  NrdI protein  36.22 
 
 
126 aa  77.4  0.00000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1404  ribonucleotide reductase stimulatory protein  36.67 
 
 
119 aa  73.9  0.0000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00373204  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3939  ribonucleotide reductase stimulatory protein  36.67 
 
 
119 aa  73.9  0.0000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00138994  normal  0.102408 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1469  ribonucleotide reductase stimulatory protein  36.67 
 
 
119 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0534212  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1440  ribonucleotide reductase stimulatory protein  36.67 
 
 
119 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000010796 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1508  ribonucleotide reductase stimulatory protein  36.67 
 
 
119 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000012533  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1266  ribonucleotide reductase stimulatory protein  36.67 
 
 
119 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.503545  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1241  ribonucleotide reductase stimulatory protein  36.67 
 
 
119 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.858034  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1369  ribonucleotide reductase stimulatory protein  36.67 
 
 
119 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0335338  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1267  ribonucleotide reductase stimulatory protein  36.67 
 
 
119 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.129347  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1062  ribonucleotide reductase stimulatory protein  36 
 
 
140 aa  72.8  0.000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000562728  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1239  ribonucleotide reductase stimulatory protein  35.83 
 
 
119 aa  72  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.316696  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1704  ribonucleotide reductase stimulatory protein  31.29 
 
 
153 aa  71.6  0.000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0804489  hitchhiker  0.00000000216411 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1073  ribonucleotide reductase stimulatory protein  35.83 
 
 
119 aa  70.5  0.000000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.882937  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0021  NrdI protein  34.07 
 
 
145 aa  68.2  0.00000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.550333 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0396  ribonucleotide reductase stimulatory protein  32.06 
 
 
132 aa  66.2  0.0000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0754  ribonucleotide reductase stimulatory protein  34.85 
 
 
132 aa  65.1  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.493486  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0771  ribonucleotide reductase stimulatory protein  34.85 
 
 
132 aa  65.1  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1515  nrdI protein  35.71 
 
 
137 aa  64.3  0.0000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000118726  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3234  Ribonucleotide reductase large subunit domain protein  33.85 
 
 
121 aa  61.6  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.177065  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3414  hypothetical protein  33.85 
 
 
121 aa  61.6  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0441882  normal  0.366327 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0199  flavoprotein NrdI  34.09 
 
 
152 aa  60.8  0.000000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.155781  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0540  NrdI protein  28.69 
 
 
133 aa  59.3  0.00000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0192  ribonucleotide reductase stimulatory protein  33.33 
 
 
118 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.171913  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1942  flavoprotein NrdI  32.58 
 
 
151 aa  53.5  0.000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.966065  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1762  NrdI family protein  27.27 
 
 
155 aa  45.8  0.0002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0924  NrdI family protein  28.28 
 
 
158 aa  40  0.01  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>