58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0924 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_0924  NrdI family protein  100 
 
 		 158 aa  327  5.0000000000000004e-89  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1762  NrdI family protein  42.95 
 
 		 155 aa  149  2e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0138  ribonucleotide reduction protein  38.16 
 
 		 155 aa  124  6e-28  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1942  flavoprotein NrdI  41.1 
 
 		 151 aa  123  9e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.966065  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0199  flavoprotein NrdI  41.67 
 
 		 152 aa  123  1e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.155781  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0255  ribonucleotide reduction protein  31.43 
 
 		 146 aa  77.4  0.00000000000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1062  ribonucleotide reductase stimulatory protein  29.86 
 
 		 140 aa  66.2  0.0000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000562728  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0140  NrdI protein  30.5 
 
 		 141 aa  63.5  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.570583 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0419  ribonucleotide reductase stimulatory protein  26.98 
 
 		 137 aa  60.8  0.000000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0680804  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl529  ribonucleotide reductase stimulatory protein  30.33 
 
 		 151 aa  59.3  0.00000002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0021  NrdI protein  28.36 
 
 		 145 aa  55.1  0.0000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.550333 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24920  ribonucleoside-diphosphate reductase 2, operon protein nrdI  25.87 
 
 		 132 aa  53.9  0.0000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.580966  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0754  ribonucleotide reductase stimulatory protein  27.94 
 
 		 132 aa  53.5  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.493486  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0771  ribonucleotide reductase stimulatory protein  27.94 
 
 		 132 aa  53.5  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0100  ribonucleotide reductase stimulatory protein  29.17 
 
 		 157 aa  52.4  0.000003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0396  ribonucleotide reductase stimulatory protein  25.74 
 
 		 132 aa  51.6  0.000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28110  ribonucleoside-diphosphate reductase 2, operon protein nrdI  27.74 
 
 		 169 aa  50.4  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0378  nrdI protein  26.57 
 
 		 134 aa  49.3  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0355  ribonucleotide reductase stimulatory protein  31.33 
 
 		 130 aa  48.5  0.00003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2989  ribonucleotide reductase stimulatory protein  27.96 
 
 		 136 aa  48.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0715726 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2954  ribonucleotide reductase stimulatory protein  27.96 
 
 		 136 aa  48.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0571032  normal  0.0132689 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2923  ribonucleotide reductase stimulatory protein  27.96 
 
 		 136 aa  48.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3006  ribonucleotide reductase stimulatory protein  28.57 
 
 		 136 aa  48.1  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00316794 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3112  ribonucleotide reductase stimulatory protein  28.57 
 
 		 136 aa  48.1  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.639432  normal  0.48077 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1267  ribonucleotide reductase stimulatory protein  30.14 
 
 		 119 aa  47.8  0.00006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.129347  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3939  ribonucleotide reductase stimulatory protein  30.14 
 
 		 119 aa  47.8  0.00007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00138994  normal  0.102408 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1404  ribonucleotide reductase stimulatory protein  30.14 
 
 		 119 aa  47.8  0.00007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00373204  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1440  ribonucleotide reductase stimulatory protein  26.71 
 
 		 119 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000010796 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1508  ribonucleotide reductase stimulatory protein  26.71 
 
 		 119 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000012533  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1469  ribonucleotide reductase stimulatory protein  26.71 
 
 		 119 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0534212  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0178  NrdI protein  27.27 
 
 		 166 aa  45.8  0.0002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1266  ribonucleotide reductase stimulatory protein  26.71 
 
 		 119 aa  46.2  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.503545  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1369  ribonucleotide reductase stimulatory protein  26.71 
 
 		 119 aa  46.2  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0335338  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1241  ribonucleotide reductase stimulatory protein  26.71 
 
 		 119 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.858034  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1009  NrdI protein  27.84 
 
 		 136 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.413651  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02494  hypothetical protein  27.84 
 
 		 136 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3918  ribonucleotide reductase stimulatory protein  27.84 
 
 		 136 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0782366 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2796  ribonucleotide reductase stimulatory protein  27.84 
 
 		 136 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0122492 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1032  ribonucleotide reductase stimulatory protein  27.84 
 
 		 136 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02530  hypothetical protein  27.84 
 
 		 136 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2955  ribonucleotide reductase stimulatory protein  27.84 
 
 		 136 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2810  ribonucleotide reductase stimulatory protein  27.84 
 
 		 136 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1073  ribonucleotide reductase stimulatory protein  28.08 
 
 		 119 aa  45.4  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.882937  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1239  ribonucleotide reductase stimulatory protein  26.71 
 
 		 119 aa  45.4  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.316696  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3205  ribonucleotide reductase stimulatory protein  27.84 
 
 		 136 aa  45.4  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0315  ribonucleotide reductase stimulatory protein  23.28 
 
 		 135 aa  44.3  0.0006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.560597  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0520  ribonucleotide reductase stimulatory protein  24.09 
 
 		 140 aa  44.7  0.0006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.295884  normal  0.147892 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0291  ribonucleotide reductase stimulatory protein  23.28 
 
 		 135 aa  44.3  0.0006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0933755  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0540  NrdI protein  23.57 
 
 		 133 aa  43.9  0.0008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13068  ribonucleotide reductase stimulatory protein  25 
 
 		 150 aa  43.5  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.151706 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0804  NrdI protein  25.9 
 
 		 132 aa  43.5  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.861092 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1704  ribonucleotide reductase stimulatory protein  19.31 
 
 		 153 aa  42  0.003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0804489  hitchhiker  0.00000000216411 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0447  NrdI protein  25.81 
 
 		 138 aa  42.4  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10190  ribonucleoside-diphosphate reductase 2, operon protein nrdI  22.48 
 
 		 138 aa  42.4  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.64466  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3132  ribonucleotide reductase stimulatory protein  25.23 
 
 		 135 aa  41.2  0.005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1147  ribonucleotide reductase stimulatory protein  25.23 
 
 		 135 aa  41.2  0.006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.874244  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3722  ribonucleotide reductase stimulatory protein  26.6 
 
 		 134 aa  41.2  0.006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.667142  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2970  NrdI protein  23.85 
 
 		 154 aa  40.8  0.007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.53176  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>