88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A3006 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A3006  ribonucleotide reductase stimulatory protein  100 
 
 
136 aa  282  1.0000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00316794 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2923  ribonucleotide reductase stimulatory protein  99.26 
 
 
136 aa  280  4.0000000000000003e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3112  ribonucleotide reductase stimulatory protein  99.26 
 
 
136 aa  279  7.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.639432  normal  0.48077 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2954  ribonucleotide reductase stimulatory protein  98.53 
 
 
136 aa  278  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0571032  normal  0.0132689 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2989  ribonucleotide reductase stimulatory protein  98.53 
 
 
136 aa  278  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0715726 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2955  ribonucleotide reductase stimulatory protein  85.29 
 
 
136 aa  244  4e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1009  NrdI protein  84.56 
 
 
136 aa  242  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.413651  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2810  ribonucleotide reductase stimulatory protein  84.56 
 
 
136 aa  242  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02530  hypothetical protein  84.56 
 
 
136 aa  242  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1032  ribonucleotide reductase stimulatory protein  84.56 
 
 
136 aa  242  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2796  ribonucleotide reductase stimulatory protein  84.56 
 
 
136 aa  242  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0122492 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3205  ribonucleotide reductase stimulatory protein  84.56 
 
 
136 aa  242  1.9999999999999999e-63  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3918  ribonucleotide reductase stimulatory protein  84.56 
 
 
136 aa  242  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0782366 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02494  hypothetical protein  84.56 
 
 
136 aa  242  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3154  ribonucleotide reductase stimulatory protein  82.35 
 
 
136 aa  235  2e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00169031  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3132  ribonucleotide reductase stimulatory protein  71.21 
 
 
135 aa  199  9e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1147  ribonucleotide reductase stimulatory protein  71.21 
 
 
135 aa  199  9.999999999999999e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.874244  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1118  ribonucleotide reductase stimulatory protein  68.94 
 
 
134 aa  196  1.0000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1064  ribonucleotide reductase stimulatory protein  68.94 
 
 
134 aa  196  1.0000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0396563  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3539  ribonucleotide reductase stimulatory protein  68.94 
 
 
141 aa  195  2.0000000000000003e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00692175  hitchhiker  0.00976656 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3722  ribonucleotide reductase stimulatory protein  65.91 
 
 
134 aa  189  1e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.667142  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0447  NrdI protein  63.5 
 
 
138 aa  179  1e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2041  ribonucleotide reductase stimulatory protein  63.24 
 
 
152 aa  177  4.999999999999999e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.692701 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1013  NrdI protein  65.15 
 
 
136 aa  176  8e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.890244  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13068  ribonucleotide reductase stimulatory protein  61.48 
 
 
150 aa  176  8e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.151706 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10190  ribonucleoside-diphosphate reductase 2, operon protein nrdI  61.07 
 
 
138 aa  176  1e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.64466  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3794  ribonucleotide reductase stimulatory protein  58.78 
 
 
137 aa  173  6e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0315  ribonucleotide reductase stimulatory protein  60.31 
 
 
135 aa  173  9e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.560597  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0291  ribonucleotide reductase stimulatory protein  60.31 
 
 
135 aa  173  9e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0933755  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2953  ribonucleotide reductase stimulatory protein  58.96 
 
 
135 aa  172  9.999999999999999e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4306  ribonucleotide reductase stimulatory protein  60.58 
 
 
148 aa  171  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3499  ribonucleotide reductase stimulatory protein  59.54 
 
 
134 aa  170  5.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.672215 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0096  NrdI protein  61.36 
 
 
138 aa  170  6.999999999999999e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.491931  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24920  ribonucleoside-diphosphate reductase 2, operon protein nrdI  59.85 
 
 
132 aa  167  3e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.580966  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7386  ribonucleotide reductase stimulatory protein  57.66 
 
 
138 aa  167  4e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.320547  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2970  NrdI protein  59.42 
 
 
154 aa  167  6e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.53176  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2357  NrdI protein  57.78 
 
 
162 aa  164  2.9999999999999998e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.248989  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1863  ribonucleotide reductase stimulatory protein  58.57 
 
 
152 aa  164  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.159531 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1797  ribonucleotide reductase stimulatory protein  58.57 
 
 
152 aa  164  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.131546  normal  0.93633 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1816  ribonucleotide reductase stimulatory protein  58.57 
 
 
152 aa  164  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.580222  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2438  NrdI protein  59.12 
 
 
143 aa  160  6e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.223638  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3290  NrdI protein  60.63 
 
 
156 aa  159  1e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4459  NrdI protein  56.49 
 
 
144 aa  156  9e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000523817 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0804  NrdI protein  60.94 
 
 
132 aa  152  1e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.861092 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl529  ribonucleotide reductase stimulatory protein  53.12 
 
 
151 aa  152  1e-36  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2118  NrdI protein  53.33 
 
 
156 aa  152  1e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000515872 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0520  ribonucleotide reductase stimulatory protein  58.14 
 
 
140 aa  152  2e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.295884  normal  0.147892 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0100  ribonucleotide reductase stimulatory protein  52.71 
 
 
157 aa  151  2e-36  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0178  NrdI protein  52.48 
 
 
166 aa  151  2.9999999999999998e-36  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4376  ribonucleotide reductase stimulatory protein  57.69 
 
 
138 aa  151  2.9999999999999998e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.526364 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1461  ribonucleotide reductase stimulatory protein  55.47 
 
 
152 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28110  ribonucleoside-diphosphate reductase 2, operon protein nrdI  54.69 
 
 
169 aa  143  9e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10480  ribonucleoside-diphosphate reductase 2, operon protein nrdI  51.52 
 
 
155 aa  139  1.9999999999999998e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00520906  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0378  nrdI protein  55.28 
 
 
134 aa  137  4.999999999999999e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0419  ribonucleotide reductase stimulatory protein  50.77 
 
 
137 aa  137  6e-32  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0680804  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0355  ribonucleotide reductase stimulatory protein  47.33 
 
 
130 aa  124  6e-28  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0140  NrdI protein  38.81 
 
 
141 aa  91.3  4e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.570583 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1404  ribonucleotide reductase stimulatory protein  38.71 
 
 
119 aa  87.8  4e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00373204  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3939  ribonucleotide reductase stimulatory protein  38.71 
 
 
119 aa  87.8  4e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00138994  normal  0.102408 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1469  ribonucleotide reductase stimulatory protein  38.71 
 
 
119 aa  87.4  6e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0534212  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1241  ribonucleotide reductase stimulatory protein  38.71 
 
 
119 aa  87.4  6e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.858034  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1440  ribonucleotide reductase stimulatory protein  38.71 
 
 
119 aa  87.4  6e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000010796 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1266  ribonucleotide reductase stimulatory protein  38.71 
 
 
119 aa  87.4  6e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.503545  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1508  ribonucleotide reductase stimulatory protein  38.71 
 
 
119 aa  87.4  6e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000012533  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1369  ribonucleotide reductase stimulatory protein  38.71 
 
 
119 aa  87.4  6e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0335338  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1267  ribonucleotide reductase stimulatory protein  38.71 
 
 
119 aa  87.4  6e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.129347  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1239  ribonucleotide reductase stimulatory protein  37.9 
 
 
119 aa  86.3  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.316696  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1073  ribonucleotide reductase stimulatory protein  37.1 
 
 
119 aa  86.3  1e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.882937  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0970  NrdI protein  38.4 
 
 
126 aa  85.9  2e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0021  NrdI protein  36.51 
 
 
145 aa  84  6e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.550333 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1704  ribonucleotide reductase stimulatory protein  34.15 
 
 
153 aa  75.5  0.0000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0804489  hitchhiker  0.00000000216411 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0396  ribonucleotide reductase stimulatory protein  37.6 
 
 
132 aa  76.3  0.0000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0771  ribonucleotide reductase stimulatory protein  38.4 
 
 
132 aa  71.2  0.000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0192  ribonucleotide reductase stimulatory protein  36.15 
 
 
118 aa  71.2  0.000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.171913  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0754  ribonucleotide reductase stimulatory protein  38.4 
 
 
132 aa  71.2  0.000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.493486  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1062  ribonucleotide reductase stimulatory protein  32.26 
 
 
140 aa  69.3  0.00000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000562728  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1515  nrdI protein  31.4 
 
 
137 aa  68.6  0.00000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000118726  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0199  flavoprotein NrdI  33.83 
 
 
152 aa  68.6  0.00000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.155781  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3234  Ribonucleotide reductase large subunit domain protein  38.4 
 
 
121 aa  65.5  0.0000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.177065  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3414  hypothetical protein  38.4 
 
 
121 aa  65.5  0.0000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0441882  normal  0.366327 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0540  NrdI protein  23.13 
 
 
133 aa  58.2  0.00000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1942  flavoprotein NrdI  27.21 
 
 
151 aa  56.2  0.0000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.966065  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0138  ribonucleotide reduction protein  30.21 
 
 
155 aa  52.8  0.000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2766  NrdI protein  23.26 
 
 
122 aa  49.3  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1762  NrdI family protein  27.27 
 
 
155 aa  48.1  0.00004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0924  NrdI family protein  28.57 
 
 
158 aa  48.1  0.00004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0255  ribonucleotide reduction protein  26.24 
 
 
146 aa  44.3  0.0006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1773  NrdI  33.82 
 
 
92 aa  42  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.524492  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>