25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_1998 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013422  Hneap_1998  protein of unknown function DUF945  100 
 
 		 445 aa  909    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2268  hypothetical protein  23.11 
 
 		 514 aa  80.9  0.00000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2016  hypothetical protein  23.84 
 
 		 502 aa  79.7  0.0000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.235486  normal  0.970517 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1689  hypothetical protein  23.84 
 
 		 502 aa  79.7  0.0000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1822  hypothetical protein  23.84 
 
 		 502 aa  79.7  0.0000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.615092  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1585  hypothetical protein  22.68 
 
 		 502 aa  79  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2324  hypothetical protein  23.84 
 
 		 502 aa  78.6  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1987  hypothetical protein  22.9 
 
 		 514 aa  78.6  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1875  hypothetical protein  22.9 
 
 		 514 aa  78.2  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.441836  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2029  protein of unknown function DUF945  23.64 
 
 		 502 aa  76.3  0.000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0265099  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01573  hypothetical protein  23.64 
 
 		 502 aa  76.3  0.000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01583  hypothetical protein  23.64 
 
 		 502 aa  76.3  0.000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1800  hypothetical protein  23.45 
 
 		 502 aa  75.5  0.000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1565  protein YdgA  23.79 
 
 		 502 aa  69.7  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.402568  normal  0.107029 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1708  protein YdgA  23.88 
 
 		 502 aa  69.7  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.366845  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1877  hypothetical protein  23.79 
 
 		 502 aa  69.7  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.710418  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1575  hypothetical protein  23.69 
 
 		 502 aa  68.2  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.193495  normal  0.310503 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1634  hypothetical protein  23.69 
 
 		 502 aa  67.4  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.00065712  normal  0.987558 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1829  hypothetical protein  21.74 
 
 		 514 aa  58.2  0.0000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00725153 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2139  protein of unknown function DUF945  20.91 
 
 		 517 aa  54.3  0.000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.434013  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0586  hypothetical protein  24.6 
 
 		 485 aa  50.4  0.00006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2276  hypothetical protein  22.42 
 
 		 509 aa  49.7  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0556311 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0605  hypothetical protein  24.61 
 
 		 485 aa  48.5  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2015  hypothetical protein  18.83 
 
 		 458 aa  45.1  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00266925  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2339  protein of unknown function DUF945  26.74 
 
 		 516 aa  43.5  0.008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>