12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_3020 on replicon NC_012028
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012028  Hlac_3020  hypothetical protein  100 
 
 
119 aa  236  9e-62  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3542  hypothetical protein  53.33 
 
 
137 aa  120  8e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2993  hypothetical protein  43.97 
 
 
131 aa  71.2  0.000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4303  Protein of unknown function DUF2078, membrane  38.89 
 
 
118 aa  59.3  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3030  hypothetical protein  50 
 
 
117 aa  55.8  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1870  hypothetical protein  37.04 
 
 
118 aa  55.5  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0355867 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2725  hypothetical protein  40 
 
 
127 aa  47  0.00009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.057147  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2159  hypothetical protein  36.47 
 
 
85 aa  41.6  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.518894  normal  0.0709956 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2525  hypothetical protein  29.41 
 
 
139 aa  40.4  0.007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.186034 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0768  hypothetical protein  37.5 
 
 
82 aa  40.4  0.009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.653371  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2741  hypothetical protein  35.53 
 
 
78 aa  40  0.01  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.389873  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0162  hypothetical protein  28.57 
 
 
93 aa  40  0.01  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000000600973  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>