12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1870 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_1870  hypothetical protein  100 
 
 		 118 aa  237  5e-62  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0355867 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4303  Protein of unknown function DUF2078, membrane  59.62 
 
 		 118 aa  113  6.9999999999999995e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3542  hypothetical protein  41.74 
 
 		 137 aa  78.6  0.00000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2993  hypothetical protein  43.64 
 
 		 131 aa  67.8  0.00000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3020  hypothetical protein  40.3 
 
 		 119 aa  53.1  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3030  hypothetical protein  75 
 
 		 117 aa  52  0.000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1380  hypothetical protein  37.88 
 
 		 76 aa  44.3  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.480252  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0768  hypothetical protein  32.81 
 
 		 82 aa  43.5  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.653371  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0952  hypothetical protein  31.08 
 
 		 80 aa  42.7  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1579  hypothetical protein  30.59 
 
 		 74 aa  41.2  0.005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2110  Protein of unknown function DUF2078, membrane  55.56 
 
 		 82 aa  40.8  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0166472  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2725  hypothetical protein  34.18 
 
 		 127 aa  40.8  0.007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.057147  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>