11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_3030 on replicon NC_012028
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012028  Hlac_3030  hypothetical protein  100 
 
 
117 aa  229  1e-59  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3542  hypothetical protein  42.62 
 
 
137 aa  85.5  2e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3020  hypothetical protein  40 
 
 
119 aa  74.3  0.0000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2993  hypothetical protein  41.51 
 
 
131 aa  68.2  0.00000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4303  Protein of unknown function DUF2078, membrane  44.14 
 
 
118 aa  65.1  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1870  hypothetical protein  43.2 
 
 
118 aa  63.2  0.000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0355867 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1136  hypothetical protein  53.85 
 
 
145 aa  42  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.516592  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2741  hypothetical protein  35 
 
 
78 aa  41.6  0.004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.389873  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0952  hypothetical protein  31.58 
 
 
80 aa  40.8  0.006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5852  hypothetical protein  35.14 
 
 
80 aa  40  0.01  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2725  hypothetical protein  37.29 
 
 
127 aa  40  0.01  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.057147  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>