13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_1136 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_1136  hypothetical protein  100 
 
 
145 aa  282  1.0000000000000001e-75  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.516592  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0430  hypothetical protein  37.36 
 
 
121 aa  55.1  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0935  hypothetical protein  36.78 
 
 
98 aa  52  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3542  hypothetical protein  32.62 
 
 
137 aa  48.9  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2741  hypothetical protein  36.9 
 
 
78 aa  48.1  0.00004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.389873  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0952  hypothetical protein  34.15 
 
 
80 aa  44.3  0.0005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0539  hypothetical protein  33.64 
 
 
139 aa  44.3  0.0005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000572124  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1380  hypothetical protein  30.34 
 
 
76 aa  42.4  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.480252  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0616  membrane protein-like protein  33.33 
 
 
85 aa  42  0.003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000019753  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0602  membrane protein-like protein  29.89 
 
 
82 aa  41.6  0.004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000788004  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3030  hypothetical protein  53.85 
 
 
117 aa  41.6  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3020  hypothetical protein  40.58 
 
 
119 aa  40.8  0.006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1303  hypothetical protein  57.58 
 
 
130 aa  40.8  0.007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0302906  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>