10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_4303 on replicon NC_013744
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013744  Htur_4303  Protein of unknown function DUF2078, membrane  100 
 
 
118 aa  230  6e-60  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1870  hypothetical protein  61.02 
 
 
118 aa  130  9e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0355867 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3542  hypothetical protein  39.02 
 
 
137 aa  79  0.00000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2993  hypothetical protein  38.1 
 
 
131 aa  74.3  0.0000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3020  hypothetical protein  42.74 
 
 
119 aa  64.3  0.0000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3030  hypothetical protein  90 
 
 
117 aa  57.8  0.00000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1136  hypothetical protein  60 
 
 
145 aa  43.5  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.516592  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0602  membrane protein-like protein  31.71 
 
 
82 aa  42.4  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000788004  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1579  hypothetical protein  29.17 
 
 
74 aa  40.8  0.006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2725  hypothetical protein  40.51 
 
 
127 aa  40.8  0.006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.057147  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>