66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0275 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_0275  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  100 
 
 		 141 aa  293  4e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2635  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  51.39 
 
 		 144 aa  147  5e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1028  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  48.59 
 
 		 144 aa  142  2e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3237  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  48.59 
 
 		 144 aa  140  5e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000891571  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3327  hypothetical protein  37.16 
 
 		 142 aa  103  6e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.765972  normal  0.0160803 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0895  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  32.85 
 
 		 142 aa  85.9  2e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.155844  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0307  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  29.51 
 
 		 133 aa  58.9  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000521553  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0228  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  29.91 
 
 		 151 aa  56.2  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1495  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  38.14 
 
 		 130 aa  56.6  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.741816  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0492  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding protein  35.71 
 
 		 132 aa  54.7  0.0000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1389  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  29.91 
 
 		 212 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1205  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  29.91 
 
 		 212 aa  51.6  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.692006 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2119  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  32.79 
 
 		 131 aa  50.1  0.000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000101081  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1307  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  27.97 
 
 		 212 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0367  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding protein  26.77 
 
 		 136 aa  50.1  0.00001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.008836  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0509  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  29.57 
 
 		 206 aa  48.9  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.069325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2463  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  28.81 
 
 		 216 aa  48.9  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24170  hypothetical protein  25.81 
 
 		 136 aa  48.9  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1018  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  42.86 
 
 		 214 aa  48.9  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.912565  decreased coverage  0.0000390202 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0594  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  36.36 
 
 		 206 aa  48.9  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0531  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  30.43 
 
 		 216 aa  48.5  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1136  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  37.18 
 
 		 213 aa  47.8  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.356422 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0634  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  35.9 
 
 		 206 aa  47.4  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.119469 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2130  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding protein  29.41 
 
 		 132 aa  47  0.00008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0416  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  29.57 
 
 		 208 aa  46.2  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.867273  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0424  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  29.57 
 
 		 208 aa  46.2  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1026  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  34.62 
 
 		 206 aa  46.2  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.392091  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0701  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding  31.91 
 
 		 142 aa  45.1  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2372  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  36.11 
 
 		 229 aa  45.4  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0765  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  28.32 
 
 		 213 aa  44.7  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0705195  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0358  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  25.35 
 
 		 134 aa  44.7  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000170822 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0741  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  33.33 
 
 		 213 aa  44.7  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.643542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0996  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding  29.32 
 
 		 137 aa  44.3  0.0006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.676275 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3130  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  26.74 
 
 		 218 aa  43.9  0.0007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0379301  normal  0.139192 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0857  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  38.03 
 
 		 222 aa  43.9  0.0008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0829  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  30.23 
 
 		 212 aa  43.9  0.0008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1263  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  32.47 
 
 		 231 aa  43.1  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1068  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  34.52 
 
 		 210 aa  43.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.326405  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0622  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  31.82 
 
 		 213 aa  43.1  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.318337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0628  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  35.62 
 
 		 218 aa  43.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3514  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  27.88 
 
 		 134 aa  43.5  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000866139  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0778  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  35.62 
 
 		 218 aa  43.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1088  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  36.99 
 
 		 204 aa  43.1  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4662  pyridoxamine-phosphate oxidase  37.97 
 
 		 222 aa  42.7  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2642  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  33.33 
 
 		 212 aa  42.4  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0555  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  34.78 
 
 		 212 aa  42.7  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.410968  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8786  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  30.68 
 
 		 231 aa  42.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.829271 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1782  pyridoxamine-phosphate oxidase  35.14 
 
 		 201 aa  42.4  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0957  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  36.76 
 
 		 212 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0815  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  35.71 
 
 		 212 aa  41.6  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.554957  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0930  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  36.76 
 
 		 212 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0724  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  31.03 
 
 		 209 aa  41.6  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.690849  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0931  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  28.57 
 
 		 199 aa  42  0.003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.151005  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3221  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  33.72 
 
 		 213 aa  41.6  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0110352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0886  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  36.62 
 
 		 214 aa  41.6  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0050  NimC/NimA family protein  24.6 
 
 		 130 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00285599  normal  0.32703 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2100  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  28.87 
 
 		 210 aa  40.8  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00869837 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30330  pyridoxamine-phosphate oxidase  34.62 
 
 		 227 aa  40.8  0.006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1992  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  28.75 
 
 		 213 aa  40.8  0.006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1895  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  34.43 
 
 		 217 aa  40.8  0.007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.85169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50800  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  30.43 
 
 		 215 aa  40.8  0.007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00587779 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1519  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  28.57 
 
 		 214 aa  40.8  0.007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000729179 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0791  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  27.01 
 
 		 165 aa  40.4  0.009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2060  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  28.87 
 
 		 213 aa  40  0.01  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.381908 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0783  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  21.98 
 
 		 151 aa  40  0.01  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.409434  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1007  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  33.33 
 
 		 216 aa  40  0.01  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>