44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2635 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_2635  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  100 
 
 		 144 aa  300  5.000000000000001e-81  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3237  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  52.74 
 
 		 144 aa  147  5e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000891571  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0275  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  51.39 
 
 		 141 aa  147  5e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1028  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  51.37 
 
 		 144 aa  144  3e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0895  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  42.34 
 
 		 142 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.155844  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3327  hypothetical protein  41.1 
 
 		 142 aa  113  7.999999999999999e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.765972  normal  0.0160803 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0050  NimC/NimA family protein  31.25 
 
 		 130 aa  56.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00285599  normal  0.32703 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1495  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  36.36 
 
 		 130 aa  55.1  0.0000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.741816  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0996  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding  35.96 
 
 		 137 aa  54.3  0.0000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.676275 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2119  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  36.56 
 
 		 131 aa  53.5  0.0000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000101081  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0228  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  28.89 
 
 		 151 aa  50.4  0.000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0367  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding protein  26.97 
 
 		 136 aa  49.3  0.00002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.008836  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0307  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  29.03 
 
 		 133 aa  48.1  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000521553  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1026  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  35.06 
 
 		 206 aa  48.1  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.392091  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0509  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  29.17 
 
 		 206 aa  47.8  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.069325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0424  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  27.12 
 
 		 208 aa  47.4  0.00006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0416  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  27.12 
 
 		 208 aa  47.4  0.00007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.867273  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0531  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  27.12 
 
 		 216 aa  46.6  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0628  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  33.75 
 
 		 218 aa  46.6  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0778  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  33.75 
 
 		 218 aa  46.6  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24170  hypothetical protein  29.55 
 
 		 136 aa  45.4  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0358  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  28.37 
 
 		 134 aa  45.4  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000170822 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0634  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  35.14 
 
 		 206 aa  44.7  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.119469 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0492  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding protein  29.89 
 
 		 132 aa  45.1  0.0004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0724  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  30.68 
 
 		 209 aa  44.7  0.0005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.690849  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3130  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  29.41 
 
 		 218 aa  44.3  0.0006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0379301  normal  0.139192 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0790  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  35.94 
 
 		 208 aa  43.9  0.0008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.150003 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0594  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  36.23 
 
 		 206 aa  43.5  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0857  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  37.31 
 
 		 222 aa  42.7  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1307  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  25.2 
 
 		 212 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1519  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  29.55 
 
 		 214 aa  42  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000729179 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1389  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  27.1 
 
 		 212 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0885  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  26.55 
 
 		 193 aa  41.6  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2060  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  24.37 
 
 		 213 aa  41.6  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.381908 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1205  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  26.17 
 
 		 212 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.692006 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1699  pyridoxal 5'-phosphate synthase  27.5 
 
 		 194 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000942056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4331  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  35.82 
 
 		 215 aa  41.2  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.262405  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0423  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  26.21 
 
 		 211 aa  41.2  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.190408  normal  0.079885 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0363  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  37.5 
 
 		 216 aa  41.2  0.005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.138758  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2606  pyridoxal 5'-phosphate synthase  23.93 
 
 		 213 aa  40.8  0.007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.397088  normal  0.714763 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4662  pyridoxamine-phosphate oxidase  31.58 
 
 		 222 aa  40.4  0.008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0829  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  30.23 
 
 		 212 aa  40.4  0.009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0443  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  33.8 
 
 		 218 aa  40.4  0.009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.732477  normal  0.141335 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1068  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  28.57 
 
 		 210 aa  40  0.01  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.326405  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>