More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4757 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_4757  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  100 
 
 
351 aa  681    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2748  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  62.43 
 
 
350 aa  398  1e-109  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.253238  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3475  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  59.3 
 
 
385 aa  392  1e-108  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4388  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  62.96 
 
 
354 aa  390  1e-107  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8993  Phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  60.83 
 
 
341 aa  385  1e-106  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.877119  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18610  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  60.06 
 
 
385 aa  387  1e-106  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.531337  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0095  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  62.22 
 
 
369 aa  384  1e-105  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.605031 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3736  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  54.84 
 
 
381 aa  381  1e-105  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7209  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  61.64 
 
 
386 aa  375  1e-103  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0442513  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1636  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  58.29 
 
 
366 aa  376  1e-103  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6858  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  60.47 
 
 
357 aa  377  1e-103  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.384013  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2907  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  58.79 
 
 
373 aa  375  1e-103  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0979418  normal  0.978058 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5048  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  62.95 
 
 
360 aa  375  1e-103  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34080  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  58.74 
 
 
367 aa  378  1e-103  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.324173 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0299  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  61.83 
 
 
347 aa  376  1e-103  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2071  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  61.47 
 
 
350 aa  375  1e-103  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3344  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  60.24 
 
 
341 aa  374  1e-102  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.448984  normal  0.675292 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0297  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  59.88 
 
 
361 aa  370  1e-101  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3088  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  57.42 
 
 
369 aa  363  2e-99  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0164  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  55.56 
 
 
381 aa  358  6e-98  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0781323  hitchhiker  0.000173938 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2351  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  56.64 
 
 
369 aa  358  7e-98  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.304441  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0155  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  55.59 
 
 
384 aa  358  9.999999999999999e-98  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6141  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  54.26 
 
 
359 aa  357  1.9999999999999998e-97  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08970  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  58.93 
 
 
382 aa  354  1e-96  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3515  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  55.98 
 
 
370 aa  351  1e-95  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.315655 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4921  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  54.86 
 
 
357 aa  349  3e-95  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4538  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  54.86 
 
 
357 aa  349  3e-95  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4625  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  54.86 
 
 
357 aa  349  3e-95  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0949  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  59.09 
 
 
369 aa  348  8e-95  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5111  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  58.29 
 
 
384 aa  347  1e-94  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.182331  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10824  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  57.14 
 
 
364 aa  346  4e-94  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.251757 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37870  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  58.36 
 
 
356 aa  343  2e-93  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.410485 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3575  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  56.03 
 
 
358 aa  341  1e-92  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0501989  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4315  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  58.46 
 
 
362 aa  340  2e-92  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06060  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  60.48 
 
 
375 aa  333  3e-90  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4040  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  57.82 
 
 
368 aa  319  5e-86  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.594606  normal  0.151358 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0261  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  47.95 
 
 
346 aa  310  2e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1440  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  46.9 
 
 
363 aa  310  2.9999999999999997e-83  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1631  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  52.08 
 
 
347 aa  308  1.0000000000000001e-82  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1624  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  48.07 
 
 
349 aa  306  3e-82  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.133695 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1856  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  47.77 
 
 
349 aa  306  3e-82  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.154474 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1129  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  47.83 
 
 
345 aa  306  3e-82  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3120  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  48.82 
 
 
347 aa  305  8.000000000000001e-82  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1351  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  48.82 
 
 
347 aa  304  2.0000000000000002e-81  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1700  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  49.1 
 
 
352 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.156273  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3524  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  48.08 
 
 
359 aa  303  3.0000000000000004e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00772577  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3187  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  47.25 
 
 
345 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2647  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  48.81 
 
 
350 aa  303  4.0000000000000003e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.42877  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1234  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  48.52 
 
 
347 aa  303  4.0000000000000003e-81  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.701579  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2695  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  48.81 
 
 
350 aa  303  4.0000000000000003e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2759  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  48.81 
 
 
345 aa  302  6.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.168086  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2737  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  48.81 
 
 
345 aa  302  6.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2868  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  48.81 
 
 
345 aa  302  6.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02148  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  47.25 
 
 
346 aa  302  7.000000000000001e-81  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1137  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  51.02 
 
 
346 aa  302  7.000000000000001e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01760  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  48.98 
 
 
351 aa  301  8.000000000000001e-81  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3689  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  48.51 
 
 
352 aa  301  1e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0683899  decreased coverage  0.000265107 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4564  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  49.13 
 
 
410 aa  301  1e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002781  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  47.16 
 
 
346 aa  301  1e-80  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52040  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  48.84 
 
 
353 aa  301  1e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00555218 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2782  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  49.11 
 
 
345 aa  300  2e-80  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.171997  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2992  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  46.51 
 
 
345 aa  300  3e-80  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.84534  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02391  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  49.11 
 
 
345 aa  299  4e-80  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0803604  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2634  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  49.11 
 
 
345 aa  299  4e-80  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.302094  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2647  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  49.11 
 
 
345 aa  299  4e-80  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2873  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  49.11 
 
 
345 aa  299  4e-80  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.636308  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02353  hypothetical protein  49.11 
 
 
345 aa  299  4e-80  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0952896  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1177  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  49.11 
 
 
345 aa  299  4e-80  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0570522 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2183  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  43.81 
 
 
340 aa  299  5e-80  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1758  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  47.4 
 
 
348 aa  299  6e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.27324  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1064  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  46.9 
 
 
345 aa  299  6e-80  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2512  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  50.14 
 
 
344 aa  298  8e-80  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000477896 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1633  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  49.1 
 
 
352 aa  298  1e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.117601 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2253  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  50.3 
 
 
356 aa  298  1e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1170  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  48.82 
 
 
345 aa  297  2e-79  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2988  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  47.62 
 
 
345 aa  297  2e-79  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.263587 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2364  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  47.45 
 
 
350 aa  297  2e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2577  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  46.33 
 
 
346 aa  296  3e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0230981  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3722  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  48.82 
 
 
345 aa  296  3e-79  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.108743  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03200  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  46.87 
 
 
346 aa  296  4e-79  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2489  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  47.15 
 
 
345 aa  295  1e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.742519  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2390  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  46.73 
 
 
346 aa  293  3e-78  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2617  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  45.95 
 
 
379 aa  293  4e-78  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1730  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  47.21 
 
 
345 aa  292  6e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000522816  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1844  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  46.69 
 
 
348 aa  292  6e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0176696  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1223  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  47.9 
 
 
352 aa  292  6e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0174491  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36890  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  48.12 
 
 
351 aa  292  7e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2996  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  47.9 
 
 
352 aa  291  1e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.55909  hitchhiker  0.000666575 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2153  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  42.41 
 
 
348 aa  291  1e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000138623  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1665  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  47.9 
 
 
352 aa  290  2e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.294401  normal  0.678153 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0732  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  45.75 
 
 
346 aa  290  2e-77  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.773105 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1263  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  47.9 
 
 
352 aa  290  2e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.045095 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4053  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  47.9 
 
 
352 aa  290  2e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2046  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  52.25 
 
 
350 aa  290  2e-77  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.200017 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1845  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  46.9 
 
 
345 aa  290  2e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000474517  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1772  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  46.99 
 
 
350 aa  290  2e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000204477  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1596  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  46.92 
 
 
345 aa  290  3e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000121366  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1819  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  45.77 
 
 
346 aa  290  3e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2760  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  47.21 
 
 
352 aa  289  4e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1513  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  46.31 
 
 
345 aa  289  4e-77  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000222973  normal  0.483677 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>