More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_5111 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_4921  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  91.32 
 
 
357 aa  642    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1636  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  97.17 
 
 
366 aa  691    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4538  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  91.32 
 
 
357 aa  642    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4625  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  91.32 
 
 
357 aa  642    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5111  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  100 
 
 
384 aa  771    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.182331  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10824  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  86.04 
 
 
364 aa  600  1e-170  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.251757 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6858  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  75.14 
 
 
357 aa  532  1e-150  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.384013  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0949  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  76.07 
 
 
369 aa  530  1e-149  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3575  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  77.72 
 
 
358 aa  525  1e-148  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0501989  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37870  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  73.8 
 
 
356 aa  499  1e-140  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.410485 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5048  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  68.86 
 
 
360 aa  483  1e-135  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0164  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  60.21 
 
 
381 aa  432  1e-120  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0781323  hitchhiker  0.000173938 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0155  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  63.9 
 
 
384 aa  431  1e-120  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6141  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  65.18 
 
 
359 aa  426  1e-118  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0095  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  61.64 
 
 
369 aa  415  9.999999999999999e-116  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.605031 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0297  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  62.99 
 
 
361 aa  414  1e-114  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4388  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  59.21 
 
 
354 aa  399  9.999999999999999e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2748  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  58.03 
 
 
350 aa  395  1e-109  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.253238  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3344  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  59.76 
 
 
341 aa  395  1e-109  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.448984  normal  0.675292 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3736  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  57.46 
 
 
381 aa  395  1e-109  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7209  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  60.22 
 
 
386 aa  396  1e-109  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0442513  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4315  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  60.78 
 
 
362 aa  397  1e-109  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8993  Phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  60.18 
 
 
341 aa  393  1e-108  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.877119  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3475  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  59.65 
 
 
385 aa  394  1e-108  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0299  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  61.06 
 
 
347 aa  389  1e-107  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3088  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  60.41 
 
 
369 aa  388  1e-107  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18610  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  57.94 
 
 
385 aa  389  1e-107  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.531337  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34080  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  60.18 
 
 
367 aa  385  1e-106  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.324173 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3515  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  58.31 
 
 
370 aa  382  1e-105  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.315655 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08970  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  53.49 
 
 
382 aa  374  1e-102  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2071  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  56.65 
 
 
350 aa  372  1e-102  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06060  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  59.48 
 
 
375 aa  370  1e-101  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2351  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  56.85 
 
 
369 aa  368  1e-101  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.304441  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2907  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  56.61 
 
 
373 aa  366  1e-100  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0979418  normal  0.978058 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4757  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  58.29 
 
 
351 aa  347  2e-94  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2364  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  50.88 
 
 
350 aa  340  2e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4040  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  55.75 
 
 
368 aa  337  2.9999999999999997e-91  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.594606  normal  0.151358 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0732  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  49.26 
 
 
346 aa  333  3e-90  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.773105 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2512  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  55.09 
 
 
344 aa  332  5e-90  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000477896 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1293  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  46.7 
 
 
350 aa  329  4e-89  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.14528e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0523  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  46.2 
 
 
336 aa  324  2e-87  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1631  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  49.42 
 
 
347 aa  322  6e-87  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2046  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  51.78 
 
 
350 aa  321  9.999999999999999e-87  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.200017 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0261  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  48.19 
 
 
346 aa  320  1.9999999999999998e-86  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2183  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  45.48 
 
 
340 aa  320  3.9999999999999996e-86  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2106  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  46.51 
 
 
349 aa  314  9.999999999999999e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000519432  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0644  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  45.35 
 
 
340 aa  315  9.999999999999999e-85  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00119245  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1777  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  47.32 
 
 
345 aa  313  2.9999999999999996e-84  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000154728  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0205  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  45.69 
 
 
346 aa  311  1e-83  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.201771 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1255  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  55.52 
 
 
345 aa  311  2e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.734003  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1772  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  48.08 
 
 
350 aa  311  2e-83  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000204477  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0725  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  50.29 
 
 
362 aa  310  2.9999999999999997e-83  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0588894  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2489  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  48.34 
 
 
345 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.742519  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2402  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  44.64 
 
 
348 aa  310  4e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.507579  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2702  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  54.73 
 
 
345 aa  309  5e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00227816  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2608  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  54.93 
 
 
345 aa  309  5.9999999999999995e-83  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1551  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  45.69 
 
 
345 aa  308  1.0000000000000001e-82  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1817  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  44.35 
 
 
348 aa  307  2.0000000000000002e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00980836 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3120  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  46.85 
 
 
347 aa  308  2.0000000000000002e-82  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3187  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  46.47 
 
 
345 aa  306  3e-82  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1844  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  45.81 
 
 
348 aa  306  4.0000000000000004e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0176696  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1129  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  46.47 
 
 
345 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1234  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  46.55 
 
 
347 aa  305  7e-82  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.701579  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2253  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  50.76 
 
 
356 aa  305  7e-82  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1351  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  46.55 
 
 
347 aa  305  7e-82  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2153  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  43.67 
 
 
348 aa  305  8.000000000000001e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000138623  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2992  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  45.87 
 
 
345 aa  305  9.000000000000001e-82  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.84534  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01760  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  48.12 
 
 
351 aa  305  1.0000000000000001e-81  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02148  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  47.65 
 
 
346 aa  304  2.0000000000000002e-81  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0310  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  45.97 
 
 
346 aa  303  2.0000000000000002e-81  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1761  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  44.29 
 
 
350 aa  303  3.0000000000000004e-81  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1476  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  51.2 
 
 
339 aa  303  3.0000000000000004e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2808  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  46.06 
 
 
352 aa  303  4.0000000000000003e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.247614  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1069  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  47.54 
 
 
348 aa  302  5.000000000000001e-81  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.750987  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1758  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  45.97 
 
 
348 aa  302  7.000000000000001e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.27324  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002781  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  46.69 
 
 
346 aa  301  9e-81  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2390  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  44.38 
 
 
346 aa  301  1e-80  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2911  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  45.71 
 
 
350 aa  301  1e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0293  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  43.73 
 
 
346 aa  300  2e-80  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52040  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  46.11 
 
 
353 aa  300  2e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00555218 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03200  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  47.27 
 
 
346 aa  300  3e-80  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0710  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  47.38 
 
 
359 aa  300  4e-80  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0701  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  47.38 
 
 
359 aa  300  4e-80  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2617  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  44.57 
 
 
379 aa  299  5e-80  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36890  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  47.34 
 
 
351 aa  299  5e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2988  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  45.43 
 
 
345 aa  299  7e-80  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.263587 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2576  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  46.7 
 
 
363 aa  298  7e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1624  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  46.13 
 
 
349 aa  298  1e-79  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.133695 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2773  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  45.14 
 
 
350 aa  298  1e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.111788  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1248  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  47.11 
 
 
340 aa  298  1e-79  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00288462  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3722  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  46.61 
 
 
345 aa  298  1e-79  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.108743  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02391  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  46.61 
 
 
345 aa  297  2e-79  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0803604  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2634  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  46.61 
 
 
345 aa  297  2e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.302094  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3524  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  45.86 
 
 
359 aa  297  2e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00772577  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0894  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  48.45 
 
 
369 aa  297  2e-79  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000980143 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02353  hypothetical protein  46.61 
 
 
345 aa  297  2e-79  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0952896  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1856  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  45.29 
 
 
349 aa  297  2e-79  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.154474 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2647  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  46.61 
 
 
345 aa  297  2e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2873  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  46.61 
 
 
345 aa  297  2e-79  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.636308  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1177  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  46.61 
 
 
345 aa  297  2e-79  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0570522 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>