56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2898 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_2898  transposase  100 
 
 		 60 aa  122  1e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.944758  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23490  transposase family protein  66.67 
 
 		 454 aa  70.9  0.000000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22400  transposase family protein  66.67 
 
 		 454 aa  70.9  0.000000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.323222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05360  transposase family protein  66.67 
 
 		 454 aa  70.9  0.000000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.711648  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1433  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  56.6 
 
 		 438 aa  52.4  0.000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.207857 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0990  transposase  54.72 
 
 		 177 aa  52  0.000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11890  transposase  54.9 
 
 		 443 aa  51.6  0.000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.565159  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09110  transposase  54.9 
 
 		 443 aa  51.6  0.000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0374233  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4581  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  56.86 
 
 		 436 aa  51.6  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0738  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  56.86 
 
 		 436 aa  51.6  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0040  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  56.86 
 
 		 436 aa  51.6  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02160  transposase family protein  52.94 
 
 		 435 aa  49.3  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.290407  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02150  transposase family protein  52.94 
 
 		 435 aa  49.3  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17110  transposase family protein  52.94 
 
 		 435 aa  49.3  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.259892  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21460  transposase family protein  52.94 
 
 		 435 aa  49.3  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  unclonable  1.3054300000000002e-18  hitchhiker  0.0000742439 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20360  transposase  52.94 
 
 		 435 aa  49.3  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24200  transposase family protein  52.94 
 
 		 435 aa  49.3  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18120  transposase family protein  54.9 
 
 		 346 aa  49.7  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.0064535  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00530  transposase  52.94 
 
 		 435 aa  49.3  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23480  transposase family protein  52.94 
 
 		 438 aa  48.5  0.00003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06980  transposase family protein  52.94 
 
 		 438 aa  48.5  0.00003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0439  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  45.76 
 
 		 433 aa  48.1  0.00005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.741864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0776  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  45.76 
 
 		 433 aa  48.1  0.00005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.688226  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22130  transposase family protein  52.94 
 
 		 362 aa  47.8  0.00005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.900439  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1169  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  45.76 
 
 		 433 aa  48.1  0.00005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0217925  normal  0.194588 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1867  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  45.76 
 
 		 433 aa  48.1  0.00005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.212682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1877  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  45.76 
 
 		 433 aa  48.1  0.00005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.493303 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0427  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  45.76 
 
 		 433 aa  48.1  0.00005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1941  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  45.76 
 
 		 433 aa  48.1  0.00005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.527296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2168  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  45.76 
 
 		 433 aa  48.1  0.00005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00169456  hitchhiker  0.0053123 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2260  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  45.76 
 
 		 433 aa  48.1  0.00005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.1027  normal  0.0456513 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3018  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  45.76 
 
 		 433 aa  48.1  0.00005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000260975 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3079  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  45.76 
 
 		 433 aa  48.1  0.00005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.397889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3429  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  45.76 
 
 		 433 aa  48.1  0.00005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.213532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4491  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  45.76 
 
 		 433 aa  48.1  0.00005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.213532  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21140  transposase family protein  50.98 
 
 		 450 aa  47  0.00009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23830  transposase family protein  50.98 
 
 		 450 aa  47  0.00009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.955203 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15140  transposase family protein  50.98 
 
 		 451 aa  47  0.00009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0303728  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23600  transposase family protein  50.98 
 
 		 438 aa  46.6  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.237959  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25600  transposase family protein  50.98 
 
 		 438 aa  46.6  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06900  transposase family protein  50.98 
 
 		 436 aa  46.6  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0445695  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22840  transposase family protein  50.98 
 
 		 438 aa  46.6  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.546721 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22440  transposase family protein  50.98 
 
 		 436 aa  46.6  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0283397  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25960  transposase family protein  50.98 
 
 		 436 aa  46.6  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04880  transposase family protein  49.02 
 
 		 435 aa  47  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06410  transposase family protein  49.02 
 
 		 435 aa  47  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22680  transposase family protein  49.02 
 
 		 311 aa  45.8  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.971541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3595  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  49.02 
 
 		 378 aa  44.7  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0104734  normal  0.17723 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3311  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  49.02 
 
 		 438 aa  43.9  0.0007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1262  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  49.02 
 
 		 438 aa  43.9  0.0007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25640  transposase family protein  49.02 
 
 		 442 aa  44.3  0.0007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12824  transposase  55.77 
 
 		 132 aa  43.5  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000191598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4632  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  48.98 
 
 		 434 aa  42.4  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.135033  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3047  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  48.98 
 
 		 434 aa  42.4  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000291896  hitchhiker  0.00289702 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2889  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  48.98 
 
 		 434 aa  42.4  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0124927  hitchhiker  0.00109872 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1245  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  48.98 
 
 		 434 aa  42.4  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.139986  normal  0.210656 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>