More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2700 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_2700  Nucleotidyl transferase  100 
 
 		 413 aa  821    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.198182  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14760  ADP-glucose pyrophosphorylase  41.25 
 
 		 428 aa  278  9e-74  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.173711 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5004  Nucleotidyl transferase  39.5 
 
 		 395 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.178624  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2327  Nucleotidyl transferase  41.38 
 
 		 399 aa  275  2.0000000000000002e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0862632  hitchhiker  0.000158734 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2144  Nucleotidyl transferase  32.05 
 
 		 418 aa  244  1.9999999999999999e-63  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0642356  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3797  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  35.73 
 
 		 417 aa  243  3.9999999999999997e-63  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0418315 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3698  nucleotidyl transferase  37.25 
 
 		 415 aa  241  2e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.526056  normal  0.0360642 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3166  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  33.42 
 
 		 426 aa  240  4e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0782  Nucleotidyl transferase  34.05 
 
 		 417 aa  237  3e-61  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4717  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  34.22 
 
 		 415 aa  236  5.0000000000000005e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.127421  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3401  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  32.78 
 
 		 426 aa  236  5.0000000000000005e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0552961  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3798  Nucleotidyl transferase  36.5 
 
 		 413 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.136621 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0946  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  34.4 
 
 		 416 aa  230  3e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.807387  normal  0.432603 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03260  ADP-glucose pyrophosphorylase  40 
 
 		 416 aa  226  4e-58  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.549069  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0947  nucleotidyl transferase  38.25 
 
 		 415 aa  226  6e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.45534 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0561  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  31.54 
 
 		 389 aa  217  2.9999999999999998e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3699  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  33.91 
 
 		 417 aa  216  7e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00250611  normal  0.0813218 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0819  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  32.02 
 
 		 402 aa  214  2.9999999999999995e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.24156 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1505  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  29.47 
 
 		 415 aa  212  1e-53  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1455  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  31.75 
 
 		 399 aa  209  5e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0708  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  31.18 
 
 		 423 aa  209  9e-53  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.810772  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0086  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  30.75 
 
 		 388 aa  207  2e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0909  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  30.67 
 
 		 418 aa  207  2e-52  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.751771  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0684  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  31.45 
 
 		 423 aa  208  2e-52  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4716  nucleotidyl transferase  34.16 
 
 		 407 aa  205  1e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.950002  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0557  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  29.97 
 
 		 393 aa  202  6e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.920393  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0241  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  29.6 
 
 		 412 aa  200  3e-50  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.558186  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0868  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  32.87 
 
 		 377 aa  199  5e-50  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00134562  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4709  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  31.83 
 
 		 376 aa  196  5.000000000000001e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5027  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  31.56 
 
 		 376 aa  196  7e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17060  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  34.05 
 
 		 399 aa  196  9e-49  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4760  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  31.56 
 
 		 376 aa  195  1e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4598  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  31.56 
 
 		 376 aa  195  1e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4620  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  31.56 
 
 		 376 aa  195  1e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5122  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  31.56 
 
 		 376 aa  195  1e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06920  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  31.45 
 
 		 390 aa  195  1e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3503  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  32.33 
 
 		 376 aa  193  5e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1049  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  31.45 
 
 		 382 aa  192  9e-48  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5008  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  31.54 
 
 		 367 aa  192  1e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4998  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  31.27 
 
 		 367 aa  191  1e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4979  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  31.54 
 
 		 367 aa  191  2e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0718  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  32.91 
 
 		 425 aa  191  2e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.917503  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0239  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  31.27 
 
 		 367 aa  191  2e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.440264  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3198  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  29.73 
 
 		 398 aa  189  8e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0854  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  30.69 
 
 		 379 aa  187  4e-46  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0620001  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0724  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  28.34 
 
 		 380 aa  181  2e-44  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000209  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  30.43 
 
 		 405 aa  181  2e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05944  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  29.8 
 
 		 404 aa  178  2e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2073  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  30.95 
 
 		 421 aa  177  4e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.755782  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0559  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  33.72 
 
 		 360 aa  176  6e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1529  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  30.41 
 
 		 421 aa  176  6e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000116874 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2838  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  31.58 
 
 		 435 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2459  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  31.58 
 
 		 435 aa  175  1.9999999999999998e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1864  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  31.01 
 
 		 423 aa  174  1.9999999999999998e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2061  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  32.38 
 
 		 439 aa  174  2.9999999999999996e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.518394 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1120  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  31.35 
 
 		 406 aa  173  3.9999999999999995e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.366661  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1474  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  30.31 
 
 		 424 aa  172  1e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0794  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  31.06 
 
 		 406 aa  171  2e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11680  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  31.23 
 
 		 414 aa  168  2e-40  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.743389  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1106  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  29.16 
 
 		 421 aa  167  2e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.495993  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3400  glucose-1-phosphate adenylyltransferase, GlgD subunit  28.65 
 
 		 372 aa  167  2.9999999999999998e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000110141  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0959  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  30.15 
 
 		 422 aa  167  2.9999999999999998e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.256851 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1175  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  31.43 
 
 		 408 aa  167  4e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1522  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  32.23 
 
 		 425 aa  167  4e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0158195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1330  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  28.87 
 
 		 405 aa  166  5e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0374066  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2246  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  31.39 
 
 		 423 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0655  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  30.26 
 
 		 423 aa  164  2.0000000000000002e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.188651  normal  0.102422 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1175  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  29.74 
 
 		 427 aa  164  3e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0905  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  30.08 
 
 		 423 aa  163  4.0000000000000004e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.693448  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2982  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  30.28 
 
 		 435 aa  163  4.0000000000000004e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.487954  normal  0.0305335 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2901  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  29.62 
 
 		 415 aa  163  6e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.218229  normal  0.117414 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0637  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  28.82 
 
 		 407 aa  162  8.000000000000001e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0063  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  30.15 
 
 		 403 aa  162  1e-38  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000122298 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2084  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  29.84 
 
 		 439 aa  162  1e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0776  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  29.41 
 
 		 423 aa  162  1e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21740  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  31.91 
 
 		 412 aa  161  2e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1691  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  29.98 
 
 		 416 aa  160  3e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.620576  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1433  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  30.65 
 
 		 421 aa  160  3e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0513  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  29.74 
 
 		 423 aa  160  5e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2092  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  30.81 
 
 		 413 aa  160  5e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.798196 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5800  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  29.26 
 
 		 423 aa  159  8e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2153  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  29.85 
 
 		 406 aa  159  8e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000824588  hitchhiker  0.00511814 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1543  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  30.77 
 
 		 413 aa  159  8e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00354872  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0118  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  30.36 
 
 		 413 aa  159  9e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1821  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  31.66 
 
 		 414 aa  159  9e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.159993 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1690  Glucose-1-phosphate adenylyltransferase  31.23 
 
 		 413 aa  159  1e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0107  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  30.1 
 
 		 413 aa  159  1e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1251  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  30.51 
 
 		 420 aa  159  1e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3581  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  30.03 
 
 		 461 aa  158  1e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1420  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  30.53 
 
 		 413 aa  159  1e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3305  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  29.79 
 
 		 404 aa  159  1e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.4162  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0508  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  30.05 
 
 		 422 aa  158  2e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0541  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  28.78 
 
 		 429 aa  157  3e-37  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1172  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  30.61 
 
 		 412 aa  156  5.0000000000000005e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.107881 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0585  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  29.01 
 
 		 440 aa  155  9e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.920968 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3717  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  29.58 
 
 		 415 aa  155  9e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.609099  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1657  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  31.39 
 
 		 419 aa  155  1e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.135992  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0990  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  28.9 
 
 		 425 aa  155  1e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.588268 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1667  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  30.77 
 
 		 412 aa  154  2e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.395811  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3114  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  31.27 
 
 		 418 aa  154  2e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.926242 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>