More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_14760 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_14760  ADP-glucose pyrophosphorylase  100 
 
 
428 aa  843    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.173711 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2700  Nucleotidyl transferase  41.01 
 
 
413 aa  278  2e-73  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.198182  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5004  Nucleotidyl transferase  38.12 
 
 
395 aa  231  2e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.178624  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03260  ADP-glucose pyrophosphorylase  39.79 
 
 
416 aa  211  3e-53  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.549069  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4717  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  33.66 
 
 
415 aa  210  4e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.127421  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2327  Nucleotidyl transferase  37.35 
 
 
399 aa  209  6e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0862632  hitchhiker  0.000158734 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2144  Nucleotidyl transferase  29.86 
 
 
418 aa  208  2e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0642356  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0782  Nucleotidyl transferase  31.07 
 
 
417 aa  206  9e-52  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3166  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  29.67 
 
 
426 aa  199  7.999999999999999e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0946  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  31.04 
 
 
416 aa  196  9e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.807387  normal  0.432603 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1505  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  29.23 
 
 
415 aa  190  4e-47  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17060  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  32.12 
 
 
399 aa  189  7e-47  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0868  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  28.99 
 
 
377 aa  189  1e-46  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00134562  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3699  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  32.11 
 
 
417 aa  187  2e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00250611  normal  0.0813218 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3797  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  30.46 
 
 
417 aa  187  2e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0418315 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3698  nucleotidyl transferase  32.3 
 
 
415 aa  186  7e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.526056  normal  0.0360642 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0909  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  28.96 
 
 
418 aa  186  7e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.751771  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0241  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  29.31 
 
 
412 aa  183  5.0000000000000004e-45  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.558186  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0819  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  28.67 
 
 
402 aa  182  1e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.24156 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0561  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  28.27 
 
 
389 aa  177  2e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1887  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  35.18 
 
 
470 aa  174  3.9999999999999995e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00088107 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0107  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  30.05 
 
 
413 aa  172  7.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0118  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  30.05 
 
 
413 aa  172  9e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3401  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  27.97 
 
 
426 aa  172  1e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0552961  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6262  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  32.78 
 
 
408 aa  170  4e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.674853  normal  0.0584137 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0086  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  27.89 
 
 
388 aa  170  5e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0100  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  30.84 
 
 
413 aa  169  7e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0900911  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2140  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  34.67 
 
 
465 aa  169  8e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.782934  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0557  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  27.96 
 
 
393 aa  169  8e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.920393  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1049  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  31.58 
 
 
382 aa  168  1e-40  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0101  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  29.4 
 
 
411 aa  168  1e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.495793  normal  0.0768686 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0947  nucleotidyl transferase  31.54 
 
 
415 aa  169  1e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.45534 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0724  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  28.21 
 
 
380 aa  169  1e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1120  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  33.51 
 
 
406 aa  168  2e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.366661  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3503  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  28.35 
 
 
376 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06920  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  27.59 
 
 
390 aa  167  2.9999999999999998e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4709  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  28.24 
 
 
376 aa  167  4e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0854  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  29.92 
 
 
379 aa  167  4e-40  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0620001  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3717  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  33.09 
 
 
415 aa  167  4e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.609099  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5027  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  27.99 
 
 
376 aa  166  5e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4760  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  27.99 
 
 
376 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4598  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  27.99 
 
 
376 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4620  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  27.99 
 
 
376 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5122  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  27.99 
 
 
376 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0239  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  27.62 
 
 
367 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.440264  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5008  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  27.88 
 
 
367 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4998  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  27.62 
 
 
367 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4979  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  27.88 
 
 
367 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0684  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  30.23 
 
 
423 aa  164  4.0000000000000004e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1420  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  32.74 
 
 
413 aa  164  4.0000000000000004e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0708  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  30.53 
 
 
423 aa  163  5.0000000000000005e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.810772  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3798  Nucleotidyl transferase  31.73 
 
 
413 aa  163  7e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.136621 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0559  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  29.49 
 
 
360 aa  162  1e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0794  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  33.16 
 
 
406 aa  161  2e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1455  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  28.42 
 
 
399 aa  161  3e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1529  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  29.9 
 
 
421 aa  160  4e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000116874 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1690  Glucose-1-phosphate adenylyltransferase  33.25 
 
 
413 aa  159  7e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1691  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  29.95 
 
 
416 aa  159  1e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.620576  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3198  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  26.76 
 
 
398 aa  157  3e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21740  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  31.5 
 
 
412 aa  157  4e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1172  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  31.25 
 
 
412 aa  155  1e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.107881 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1667  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  31.25 
 
 
412 aa  155  1e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.395811  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0600  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  31 
 
 
414 aa  155  1e-36  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.910343  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2318  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  32.26 
 
 
423 aa  154  2e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.300478  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2073  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  30.3 
 
 
421 aa  154  2e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.755782  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1821  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  31.53 
 
 
414 aa  155  2e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.159993 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4503  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  31.28 
 
 
404 aa  155  2e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1864  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  30.73 
 
 
423 aa  154  2.9999999999999998e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2901  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  30.61 
 
 
415 aa  154  2.9999999999999998e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.218229  normal  0.117414 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05944  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  29.47 
 
 
404 aa  154  4e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3305  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  32.22 
 
 
404 aa  154  4e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.4162  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000209  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  28.46 
 
 
405 aa  153  5e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0959  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  29.9 
 
 
422 aa  153  5e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.256851 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3935  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  26.71 
 
 
425 aa  152  8.999999999999999e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1330  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  27.58 
 
 
405 aa  152  1e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0374066  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0655  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  29.62 
 
 
423 aa  152  1e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.188651  normal  0.102422 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0637  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  28.46 
 
 
407 aa  150  3e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1106  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  28.18 
 
 
421 aa  150  3e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.495993  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2193  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  30.53 
 
 
404 aa  150  3e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.992249 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2113  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  32.74 
 
 
408 aa  150  4e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.696559  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11680  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  31.42 
 
 
414 aa  150  4e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.743389  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4134  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  26.95 
 
 
425 aa  150  4e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.527563  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1433  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  29.48 
 
 
421 aa  149  1.0000000000000001e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0279  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  27.79 
 
 
427 aa  148  2.0000000000000003e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2931  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  29.95 
 
 
420 aa  147  3e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3024  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  29.95 
 
 
420 aa  147  5e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.823168  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1324  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  29.95 
 
 
420 aa  147  5e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1251  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  30.37 
 
 
420 aa  146  5e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0385  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  29.1 
 
 
420 aa  146  6e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11237  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  29.97 
 
 
404 aa  146  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000384195  normal  0.0353378 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2755  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  29.72 
 
 
420 aa  146  7.0000000000000006e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2833  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  29.72 
 
 
420 aa  146  7.0000000000000006e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1889  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  27.93 
 
 
422 aa  146  7.0000000000000006e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.350932 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1797  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  27.86 
 
 
422 aa  145  1e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.477582  normal  0.903839 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1334  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  29.72 
 
 
420 aa  145  1e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2092  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  29.77 
 
 
413 aa  145  1e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.798196 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2153  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  31.2 
 
 
406 aa  145  2e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000824588  hitchhiker  0.00511814 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4000  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  29.61 
 
 
404 aa  145  2e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.222543  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4074  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  29.61 
 
 
404 aa  145  2e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.058709  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4716  nucleotidyl transferase  30.08 
 
 
407 aa  145  2e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.950002  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>