More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1175 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3305  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  82.54 
 
 		 404 aa  644    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.4162  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1175  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  100 
 
 		 427 aa  868    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4000  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  78.25 
 
 		 404 aa  624  1e-178  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.222543  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4074  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  78.25 
 
 		 404 aa  624  1e-178  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.058709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4230  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  78.25 
 
 		 404 aa  623  1e-177  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.185443 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2193  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  78.29 
 
 		 404 aa  612  9.999999999999999e-175  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.992249 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4503  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  77.52 
 
 		 404 aa  610  1e-173  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11237  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  75.97 
 
 		 404 aa  597  1e-169  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000384195  normal  0.0353378 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0794  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  70.43 
 
 		 406 aa  578  1e-164  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1120  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  67.17 
 
 		 406 aa  546  1e-154  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.366661  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2153  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  67.25 
 
 		 406 aa  533  1e-150  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000824588  hitchhiker  0.00511814 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1667  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  63.48 
 
 		 412 aa  512  1e-144  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.395811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2092  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  61.46 
 
 		 413 aa  503  1e-141  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.798196 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1821  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  61.37 
 
 		 414 aa  504  1e-141  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.159993 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2113  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  62.09 
 
 		 408 aa  502  1e-141  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.696559  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6262  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  60.85 
 
 		 408 aa  498  1e-140  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.674853  normal  0.0584137 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2901  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  61.67 
 
 		 415 aa  490  1e-137  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.218229  normal  0.117414 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2318  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  59.17 
 
 		 423 aa  476  1e-133  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.300478  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1420  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  58.44 
 
 		 413 aa  473  1e-132  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2140  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  58.17 
 
 		 465 aa  472  1e-132  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.782934  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21740  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  58.77 
 
 		 412 aa  466  9.999999999999999e-131  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3717  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  59.02 
 
 		 415 aa  467  9.999999999999999e-131  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.609099  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1172  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  57.7 
 
 		 412 aa  464  1e-129  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.107881 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1887  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  57.32 
 
 		 470 aa  464  1e-129  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00088107 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1690  Glucose-1-phosphate adenylyltransferase  58.33 
 
 		 413 aa  457  1e-127  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0600  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  56.23 
 
 		 414 aa  457  1e-127  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.910343  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11680  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  57.14 
 
 		 414 aa  451  1e-125  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.743389  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15870  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  57 
 
 		 413 aa  439  9.999999999999999e-123  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0214399  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5800  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  52.58 
 
 		 423 aa  422  1e-117  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0118  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  47.67 
 
 		 413 aa  406  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0100  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  47.91 
 
 		 413 aa  407  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0900911  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0107  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  47.67 
 
 		 413 aa  406  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003947  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  47.64 
 
 		 405 aa  399  9.999999999999999e-111  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.870453  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0101  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  47.42 
 
 		 411 aa  396  1e-109  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.495793  normal  0.0768686 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0238  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  47.39 
 
 		 418 aa  392  1e-108  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1330  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  45.66 
 
 		 405 aa  390  1e-107  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0374066  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01575  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  46.9 
 
 		 405 aa  390  1e-107  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3033  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  44.36 
 
 		 409 aa  378  1e-103  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3034  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  44.33 
 
 		 407 aa  377  1e-103  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0637  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  47.1 
 
 		 407 aa  372  1e-102  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0959  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  45.81 
 
 		 422 aa  370  1e-101  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.256851 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0508  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  46.13 
 
 		 422 aa  366  1e-100  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0861  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  44.74 
 
 		 413 aa  366  1e-100  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.506105  normal  0.404079 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0905  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  46.21 
 
 		 423 aa  365  1e-99  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.693448  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0349  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  45.5 
 
 		 413 aa  365  1e-99  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0806  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  45.26 
 
 		 413 aa  360  3e-98  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.462014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0776  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  44.5 
 
 		 423 aa  360  4e-98  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1529  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  45.07 
 
 		 421 aa  358  7e-98  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000116874 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1368  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  44.58 
 
 		 427 aa  358  8e-98  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.782994  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1864  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  44.72 
 
 		 423 aa  356  3.9999999999999996e-97  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05944  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  45.25 
 
 		 404 aa  356  5e-97  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2838  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  44.78 
 
 		 435 aa  355  7.999999999999999e-97  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1106  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  44.58 
 
 		 421 aa  354  2e-96  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.495993  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2061  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  45.25 
 
 		 439 aa  352  5e-96  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.518394 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2459  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  44.53 
 
 		 435 aa  352  5.9999999999999994e-96  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2044  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  45.39 
 
 		 422 aa  352  8.999999999999999e-96  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.11896  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2073  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  44.01 
 
 		 421 aa  351  2e-95  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.755782  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1251  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  45.27 
 
 		 420 aa  350  2e-95  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1543  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  45.02 
 
 		 420 aa  350  3e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0541  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  45.66 
 
 		 429 aa  348  9e-95  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1474  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  43.69 
 
 		 424 aa  348  1e-94  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0990  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  44.74 
 
 		 425 aa  348  1e-94  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.588268 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2934  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  44.78 
 
 		 421 aa  348  1e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.17084  normal  0.531544 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0655  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  45.04 
 
 		 423 aa  348  1e-94  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.188651  normal  0.102422 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1324  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  44.78 
 
 		 420 aa  347  2e-94  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1691  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  44.58 
 
 		 416 aa  347  2e-94  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.620576  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1889  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  44.91 
 
 		 422 aa  348  2e-94  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.350932 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2932  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  44.36 
 
 		 420 aa  347  2e-94  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00275218  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1797  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  44.47 
 
 		 422 aa  347  2e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.477582  normal  0.903839 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2931  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  44.03 
 
 		 420 aa  347  2e-94  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1360  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  44.78 
 
 		 420 aa  347  2e-94  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.279951 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1171  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  43.57 
 
 		 424 aa  347  2e-94  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.591039 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3024  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  44.78 
 
 		 420 aa  347  2e-94  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.823168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1334  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  44.53 
 
 		 420 aa  346  4e-94  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2755  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  43.78 
 
 		 420 aa  346  4e-94  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2833  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  43.78 
 
 		 420 aa  346  4e-94  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1498  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  44.03 
 
 		 420 aa  345  1e-93  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02421  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  44.25 
 
 		 431 aa  344  2e-93  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.962806  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1020  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  42.39 
 
 		 417 aa  343  4e-93  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0841522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1433  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  43.51 
 
 		 421 aa  342  1e-92  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0585  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  40.71 
 
 		 440 aa  340  2e-92  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.920968 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0513  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  45 
 
 		 423 aa  341  2e-92  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000209  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  43.83 
 
 		 405 aa  340  2e-92  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1242  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  41.44 
 
 		 417 aa  340  2.9999999999999998e-92  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3114  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  44.09 
 
 		 418 aa  339  5e-92  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.926242 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1543  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  41.73 
 
 		 413 aa  338  9.999999999999999e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00354872  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03282  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  40.53 
 
 		 438 aa  337  3.9999999999999995e-91  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000760343  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2886  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  43.81 
 
 		 423 aa  337  3.9999999999999995e-91  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.935845  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0718  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  43 
 
 		 425 aa  336  3.9999999999999995e-91  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.917503  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1532  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  43.81 
 
 		 423 aa  337  3.9999999999999995e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.268941 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0284  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  40.84 
 
 		 431 aa  336  5e-91  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000350445  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0282  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  40.84 
 
 		 431 aa  336  5e-91  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.000000242921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3712  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  40.84 
 
 		 431 aa  336  5e-91  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.499827  normal  0.460208 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3630  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  40.84 
 
 		 431 aa  336  5e-91  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4742  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  40.84 
 
 		 431 aa  336  5e-91  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3909  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  40.84 
 
 		 431 aa  336  5e-91  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03235  hypothetical protein  40.84 
 
 		 431 aa  336  5e-91  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000332683  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2982  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  42.43 
 
 		 435 aa  335  7e-91  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.487954  normal  0.0305335 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3894  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  40.84 
 
 		 431 aa  335  7.999999999999999e-91  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0225  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  41.89 
 
 		 428 aa  335  7.999999999999999e-91  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.832621  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>