More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2079 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_2079  nitrogen regulatory protein P-II  100 
 
 		 112 aa  217  3.9999999999999997e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.114864  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1957  nitrogen regulatory protein P-II  92.86 
 
 		 112 aa  207  4e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.158303  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1937  nitrogen regulatory protein P-II  92.86 
 
 		 112 aa  207  4e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2003  nitrogen regulatory protein P-II  92.86 
 
 		 112 aa  207  4e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0914763  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5933  nitrogen regulatory protein P-II  84.82 
 
 		 112 aa  197  3.9999999999999996e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12933  nitrogen regulatory protein P-II glnB  86.61 
 
 		 112 aa  196  7.999999999999999e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.30403e-36  normal  0.258229 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1609  nitrogen regulatory protein P-II  91.96 
 
 		 112 aa  177  2.9999999999999997e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0701644  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1565  nitrogen regulatory protein P-II  75 
 
 		 112 aa  168  3e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.204869  normal  0.0818079 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4014  nitrogen regulatory protein P-II  73.21 
 
 		 112 aa  166  8e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00726508  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2179  nitrogen regulatory protein P-II  95.54 
 
 		 112 aa  166  9e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.559384 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4184  nitrogen regulatory protein P-II  95.54 
 
 		 112 aa  166  9e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.739575  normal  0.508363 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1188  nitrogen regulatory protein P-II  71.43 
 
 		 112 aa  165  2e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0671677  hitchhiker  0.00271711 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1786  nitrogen regulatory protein P-II  70.54 
 
 		 112 aa  163  8e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1299  nitrogen regulatory protein P-II  69.64 
 
 		 117 aa  162  1.0000000000000001e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.770143  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7999  nitrogen regulatory protein P-II  70.54 
 
 		 112 aa  160  5.0000000000000005e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2546  nitrogen regulatory protein P-II  68.75 
 
 		 112 aa  158  2e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.164416 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4813  nitrogen regulatory protein P-II  67.86 
 
 		 112 aa  159  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.311514  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3163  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  157  4e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.105283  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1074  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  156  9e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2036  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 		 112 aa  155  1e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.504448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0564  nitrogen regulatory protein P-II  67.86 
 
 		 112 aa  155  1e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000717962  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3119  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 		 112 aa  155  1e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1466  nitrogen regulatory protein P-II  69.37 
 
 		 113 aa  155  1e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.629362 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2480  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 		 112 aa  155  2e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.312055  normal  0.888078 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0642  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  63.39 
 
 		 112 aa  155  2e-37  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0211837  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0981  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 		 112 aa  155  2e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.502811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0552  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 		 112 aa  154  3e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.524059  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1183  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  154  5.0000000000000005e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000414961 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3078  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  154  5.0000000000000005e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000004264  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0047  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 		 112 aa  153  6e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000287221  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1836  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  153  7e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0337137  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2357  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 		 112 aa  153  7e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23790  nitrogen regulatory protein P-II  67.86 
 
 		 112 aa  153  8e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.411454  normal  0.269755 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2530  nitrogen regulatory protein P-II  65.18 
 
 		 112 aa  153  8e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2915  nitrogen regulatory protein P-II 2  65.18 
 
 		 112 aa  153  8e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0326538  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3942  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 		 112 aa  153  9e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0171  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  153  9e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.138781  normal  0.605066 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0195  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 		 112 aa  152  1e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.863029 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1831  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 114 aa  152  1e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3223  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 		 112 aa  152  1e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.808026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1957  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 		 112 aa  152  1e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1133  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 		 112 aa  152  1e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2866  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 		 136 aa  152  1e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00138557  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0302  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  152  2e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2783  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 		 112 aa  152  2e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.190051  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0437  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 		 112 aa  152  2e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1168  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 		 112 aa  152  2e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.474784  normal  0.334361 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1351  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 		 112 aa  151  2e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000771293  hitchhiker  0.0000000000923382 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1879  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 		 112 aa  151  2e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000257329  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0421  nitrogen regulatory protein P-II  72.97 
 
 		 113 aa  152  2e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.666216 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0234  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 		 112 aa  151  2e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000834653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2877  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 		 112 aa  152  2e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.58077  normal  0.596742 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1235  Nitrogen regulatory protein PII  64.29 
 
 		 112 aa  152  2e-36  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2252  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 		 112 aa  152  2e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0233324  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1071  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  151  2e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2921  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 		 112 aa  152  2e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0772673  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0525  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 		 112 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.887906  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0256  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 		 112 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1181  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 		 112 aa  151  2.9999999999999998e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000688194 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4190  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 		 112 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.959597 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2479  nitrogen regulatory protein P-II  59.82 
 
 		 112 aa  151  2.9999999999999998e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.494885  normal  0.880519 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3819  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 		 112 aa  150  4e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1069  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 		 112 aa  150  4e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.607168  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2408  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 		 112 aa  151  4e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.82113  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2477  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 		 112 aa  151  4e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.698113  normal  0.567778 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1494  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  150  4e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0935  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 		 112 aa  150  4e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0360863  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0342  nitrogen regulatory P-II transcription regulator protein  62.5 
 
 		 112 aa  150  5e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3519  nitrogen regulatory protein P-II 1  62.5 
 
 		 112 aa  150  5e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2478  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 		 112 aa  150  5e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.464409  normal  0.572942 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0371  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  58.93 
 
 		 112 aa  150  5e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0240  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  59.82 
 
 		 112 aa  150  5e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.289663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2945  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 		 112 aa  150  5e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0214654  normal  0.391037 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3027  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 		 112 aa  150  5e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.749503 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0800  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 		 112 aa  150  5e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3124  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 		 112 aa  150  5e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.473866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1680  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 		 112 aa  150  5e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000892392  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3161  nitrogen regulatory protein P-II  59.82 
 
 		 112 aa  150  5.9999999999999996e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0791702  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2044  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 		 112 aa  150  7e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4832  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 		 112 aa  150  7e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2709  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  150  7e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000195324 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3119  nitrogen regulatory protein P-II  66.04 
 
 		 112 aa  149  8e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0878953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4397  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  150  8e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.467345 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4248  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  150  8e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.415508  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2345  nitrogen regulatory P-II transcription regulator protein  64.15 
 
 		 112 aa  149  8.999999999999999e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.782832  normal  0.263317 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2406  nitrogen regulatory protein P-II  59.82 
 
 		 112 aa  149  8.999999999999999e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0969  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 		 112 aa  149  8.999999999999999e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.916041  hitchhiker  0.000334887 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0217  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 		 112 aa  149  1e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000368327 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0198  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 		 112 aa  149  1e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.485304 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0468  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 		 112 aa  149  1e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.409463  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0291  nitrogen regulatory protein P-II  59.82 
 
 		 112 aa  149  1e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2560  nitrogen regulatory protein P-II  62.62 
 
 		 112 aa  149  1e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.24557  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0651  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 		 112 aa  149  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.888486  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0321  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 		 112 aa  149  1e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0407  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 		 112 aa  149  1e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.32852  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1110  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 		 112 aa  149  1e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000614062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0487  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 		 112 aa  149  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.188054  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2361  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 		 112 aa  149  1e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2827  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 		 112 aa  149  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.994537  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0485  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 		 112 aa  149  1e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.65619  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>