91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_2619 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_2619  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  100 
 
 		 177 aa  367  1e-101  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.755564  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1610  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  98.87 
 
 		 177 aa  363  1e-100  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1803  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  82.02 
 
 		 178 aa  298  2e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0104845  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2086  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  65.12 
 
 		 179 aa  248  3e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2809  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  61.4 
 
 		 177 aa  242  1.9999999999999999e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1445  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  61.99 
 
 		 177 aa  241  3e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1704  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  31.69 
 
 		 159 aa  74.3  0.0000000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1831  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  25.66 
 
 		 159 aa  60.1  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000011696  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1832  Fe-S-cluster-containing hydrogenase components 2  28.95 
 
 		 158 aa  60.1  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0153  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  29.63 
 
 		 251 aa  55.8  0.0000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1627  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  25.17 
 
 		 201 aa  53.1  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3292  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  27.22 
 
 		 164 aa  51.6  0.000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.42219  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2812  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  28.37 
 
 		 159 aa  51.6  0.000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0501046  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0721  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  28.78 
 
 		 159 aa  51.2  0.000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000221809  normal  0.228333 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3943  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  26.81 
 
 		 164 aa  50.8  0.000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3045  4Fe-4S binding protein  30.77 
 
 		 162 aa  50.8  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1298  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  28.91 
 
 		 178 aa  50.8  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02680  hypothetical protein  30.77 
 
 		 162 aa  50.8  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3211  4Fe-4S binding protein  30.77 
 
 		 162 aa  50.1  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.624865  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2582  iron-sulfur cluster-binding protein; potential subunit of aldehyde oxidoreductase  25.15 
 
 		 158 aa  50.1  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1841  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  30.37 
 
 		 139 aa  49.7  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.00000000000340892  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0823  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  30.77 
 
 		 162 aa  50.1  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3018  4Fe-4S binding protein  30.77 
 
 		 162 aa  50.1  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1816  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  25.55 
 
 		 157 aa  49.7  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000160939 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0807  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  30.77 
 
 		 162 aa  50.1  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2063  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  27.03 
 
 		 172 aa  49.3  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0536  pyrogallol hydroxytransferase  23.75 
 
 		 271 aa  49.3  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1412  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  27.87 
 
 		 182 aa  48.9  0.00004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.998302  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1834  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  24.54 
 
 		 168 aa  48.5  0.00005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0382  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  28.47 
 
 		 162 aa  48.1  0.00007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.248119  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2851  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  24.82 
 
 		 187 aa  48.1  0.00007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.944597  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1766  nitrate reductase electron transfer subunit  30.82 
 
 		 137 aa  47.8  0.00008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2051  nitrate reductase electron transfer subunit  30.82 
 
 		 137 aa  47.8  0.00008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0189  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  27.59 
 
 		 180 aa  47.8  0.00008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0165  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  25 
 
 		 185 aa  47.4  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000823562 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4010  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  24.86 
 
 		 176 aa  46.6  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.7476  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2280  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  24.39 
 
 		 226 aa  46.2  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000058005  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1569  formate dehydrogenase beta subunit  24.06 
 
 		 256 aa  46.6  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2352  aspartate carbamoyltransferase  26.09 
 
 		 615 aa  45.8  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.525295 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0048  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  24.09 
 
 		 158 aa  45.8  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.146084 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2187  4Fe-4S binding domain protein  25.15 
 
 		 192 aa  44.7  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2234  4Fe-4S binding domain protein  25.15 
 
 		 192 aa  44.7  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000685174  normal  0.177252 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1216  formate dehydrogenase, beta subunit, putative  21.23 
 
 		 235 aa  44.7  0.0007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0965219 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2287  4Fe-4S binding domain-containing protein  25.15 
 
 		 192 aa  44.7  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.843774  normal  0.0555525 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2241  4Fe-4S binding domain protein  25.15 
 
 		 192 aa  44.7  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2400  4Fe-4S binding domain-containing protein  25.34 
 
 		 192 aa  44.7  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.391337  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24630  Fe-S-cluster-containing hydrogenase subunit  28.24 
 
 		 158 aa  44.3  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.538569  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0598  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  23.93 
 
 		 166 aa  43.5  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.594311  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4219  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  27.16 
 
 		 177 aa  43.9  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03376  hypothetical protein  29.25 
 
 		 157 aa  43.9  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03425  predicted hydrogenase, 4Fe-4S ferredoxin-type component  29.25 
 
 		 157 aa  43.9  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0137  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  29.25 
 
 		 157 aa  43.9  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4061  polysulfide reductase, subunit B  25.49 
 
 		 188 aa  44.3  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0141  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  29.25 
 
 		 157 aa  43.9  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3443  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  25.49 
 
 		 188 aa  43.9  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3618  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  25.49 
 
 		 188 aa  44.3  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3777  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  29.8 
 
 		 157 aa  43.5  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1520  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  25.32 
 
 		 176 aa  43.9  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00277868 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0146  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  26.95 
 
 		 153 aa  43.5  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.778378 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3949  4Fe-4S binding domain protein  29.86 
 
 		 157 aa  43.5  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4070  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  29.14 
 
 		 157 aa  42.7  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4949  4Fe-4S binding domain protein  29.86 
 
 		 157 aa  43.1  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.773507 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0445  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  23.93 
 
 		 168 aa  43.1  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.112041 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1514  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding  27.14 
 
 		 442 aa  42.4  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.155539  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1666  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  24.84 
 
 		 168 aa  42.4  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0556  formate dehydrogenase, beta subunit, putative  22.35 
 
 		 219 aa  42.4  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2934  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  26.35 
 
 		 149 aa  42  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000214822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3038  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  25.88 
 
 		 190 aa  42  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0612  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  24.84 
 
 		 188 aa  42  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2849  electron transport protein HydN  26.9 
 
 		 175 aa  42  0.005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4597  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  25 
 
 		 169 aa  42  0.005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3164  electron transport protein HydN  26.9 
 
 		 175 aa  42  0.005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3963  electron transport protein HydN  26.9 
 
 		 175 aa  42  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02563  formate dehydrogenase-H, [4Fe-4S] ferredoxin subunit  26.9 
 
 		 175 aa  42  0.005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3176  polysulfide reductase, subunit B  25.97 
 
 		 188 aa  41.6  0.005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2997  electron transport protein HydN  26.9 
 
 		 175 aa  42  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02528  hypothetical protein  26.9 
 
 		 175 aa  42  0.005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2836  electron transport protein HydN  26.9 
 
 		 175 aa  42  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0600195 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0976  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  26.9 
 
 		 175 aa  42  0.005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.961546  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0999  electron transport protein HydN  26.9 
 
 		 175 aa  42  0.005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00184229 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1198  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  27.74 
 
 		 154 aa  41.6  0.006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.827111  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3896  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  28.48 
 
 		 157 aa  41.6  0.006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0312  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  27.1 
 
 		 137 aa  41.6  0.006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1291  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  46.15 
 
 		 151 aa  41.6  0.006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00252517 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0508  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  24.84 
 
 		 188 aa  41.6  0.006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4277  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  25 
 
 		 173 aa  41.2  0.008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0227  formate dehydrogenase, beta subunit, putative  22.78 
 
 		 242 aa  41.2  0.008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0939177 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0556  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  26.39 
 
 		 188 aa  41.2  0.009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0560  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  26.39 
 
 		 188 aa  41.2  0.009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0532  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  26.39 
 
 		 188 aa  41.2  0.009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1634  molybdopterin oxidoreductase  26.71 
 
 		 1087 aa  40.8  0.01  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>