70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_2809 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_2809  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  100 
 
 		 177 aa  364  1e-100  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1445  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  96.61 
 
 		 177 aa  354  5e-97  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2086  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  85.14 
 
 		 179 aa  318  1.9999999999999998e-86  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1803  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  63.58 
 
 		 178 aa  238  2.9999999999999997e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0104845  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2619  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  60.8 
 
 		 177 aa  234  4e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.755564  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1610  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  60.8 
 
 		 177 aa  234  5.0000000000000005e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1704  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  33.09 
 
 		 159 aa  67  0.0000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1831  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  30.43 
 
 		 159 aa  63.5  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000011696  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1832  Fe-S-cluster-containing hydrogenase components 2  29.58 
 
 		 158 aa  61.2  0.000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2063  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  30.41 
 
 		 172 aa  59.3  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1841  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  30.88 
 
 		 139 aa  57.8  0.00000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.00000000000340892  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1627  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  28.12 
 
 		 201 aa  56.6  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2812  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  31.21 
 
 		 159 aa  56.6  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0501046  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0153  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  31.3 
 
 		 251 aa  55.8  0.0000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2582  iron-sulfur cluster-binding protein; potential subunit of aldehyde oxidoreductase  30.22 
 
 		 158 aa  55.5  0.0000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1412  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  30.4 
 
 		 182 aa  52.8  0.000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.998302  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2851  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  28.06 
 
 		 187 aa  52.8  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.944597  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1298  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  31.34 
 
 		 178 aa  52.8  0.000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0721  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  31.65 
 
 		 159 aa  52.8  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000221809  normal  0.228333 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1816  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  27.34 
 
 		 157 aa  52.4  0.000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000160939 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0048  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  27.34 
 
 		 158 aa  50.4  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.146084 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3292  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  29.2 
 
 		 164 aa  50.4  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.42219  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3943  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  27.74 
 
 		 164 aa  49.3  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2280  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  25.15 
 
 		 226 aa  48.9  0.00004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000058005  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24630  Fe-S-cluster-containing hydrogenase subunit  31.16 
 
 		 158 aa  47.8  0.00009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.538569  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0536  pyrogallol hydroxytransferase  24.52 
 
 		 271 aa  47.4  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0312  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  32.04 
 
 		 137 aa  47  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1514  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding  25.81 
 
 		 442 aa  47  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.155539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1834  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  24.71 
 
 		 168 aa  46.2  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0382  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  27.46 
 
 		 162 aa  45.8  0.0003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.248119  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2352  aspartate carbamoyltransferase  27.67 
 
 		 615 aa  45.8  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.525295 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0551  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  28.29 
 
 		 185 aa  45.1  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1198  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  27.78 
 
 		 154 aa  44.7  0.0006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.827111  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0071  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  25.54 
 
 		 189 aa  44.7  0.0008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0445  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  27.67 
 
 		 168 aa  44.3  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.112041 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3038  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  26.9 
 
 		 190 aa  43.9  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2051  nitrate reductase electron transfer subunit  28.97 
 
 		 137 aa  43.9  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1766  nitrate reductase electron transfer subunit  28.97 
 
 		 137 aa  43.9  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1520  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  27.95 
 
 		 176 aa  43.9  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00277868 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4220  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  25.77 
 
 		 667 aa  43.5  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0165  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  24.04 
 
 		 185 aa  43.1  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000823562 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0556  formate dehydrogenase, beta subunit, putative  24 
 
 		 219 aa  43.5  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4011  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  27.91 
 
 		 671 aa  43.1  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3042  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  26.46 
 
 		 744 aa  43.5  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2085  iron-sulfur cluster-binding protein  28.67 
 
 		 168 aa  43.5  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0439834  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1133  iron-sulfur cluster-binding protein  26.76 
 
 		 143 aa  43.1  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00000983522  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_951  iron-sulfur cluster domain protein  26.76 
 
 		 143 aa  43.1  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000475375  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0962  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  26.76 
 
 		 143 aa  42.7  0.003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000636353  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4597  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  25.81 
 
 		 169 aa  42.7  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1338  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  28.26 
 
 		 147 aa  42.7  0.003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1569  formate dehydrogenase beta subunit  25 
 
 		 256 aa  42  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2008  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  26.72 
 
 		 173 aa  42  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1884  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  28.17 
 
 		 176 aa  42  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0059  Fe-S-cluster-containing hydrogenase components 1  25.81 
 
 		 198 aa  42  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000464902  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2316  ubiquinol cytochrome c oxidoreductase, cytochrome b subunit  27.81 
 
 		 183 aa  42  0.005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.581036  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3443  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  28.67 
 
 		 188 aa  42  0.005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2966  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  26.03 
 
 		 451 aa  41.6  0.006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.451629  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03376  hypothetical protein  26.57 
 
 		 157 aa  41.2  0.007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0137  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  26.57 
 
 		 157 aa  41.2  0.007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0141  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  26.57 
 
 		 157 aa  41.2  0.007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3618  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  28.67 
 
 		 188 aa  41.2  0.007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03425  predicted hydrogenase, 4Fe-4S ferredoxin-type component  26.57 
 
 		 157 aa  41.2  0.007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0105  formate dehydrogenase, beta subunit  24.2 
 
 		 303 aa  41.2  0.008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0106  formate dehydrogenase, beta subunit  24.2 
 
 		 303 aa  41.2  0.008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0101  formate dehydrogenase, beta subunit  24.2 
 
 		 303 aa  41.2  0.008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0119  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  25.15 
 
 		 517 aa  41.2  0.008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0357166  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4061  polysulfide reductase, subunit B  28.67 
 
 		 188 aa  40.8  0.009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1634  molybdopterin oxidoreductase  26.81 
 
 		 1087 aa  40.8  0.01  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0439  formate dehydrogenase, beta subunit  25.15 
 
 		 300 aa  40.8  0.01  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2798  aspartate carbamoyltransferase  28.47 
 
 		 686 aa  40.8  0.01  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.604393  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>