33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_0902 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_0902  rod shape-determining protein MreD  100 
 
 		 172 aa  346  8e-95  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2547  rod shape-determining protein MreD  71.51 
 
 		 172 aa  256  2e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000782724  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4184  rod shape-determining protein  39.1 
 
 		 181 aa  119  3e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4195  rod shape-determining protein  39.1 
 
 		 181 aa  119  3e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4542  rod shape-determining protein MreD  39.1 
 
 		 181 aa  118  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4584  rod shape-determining protein MreD  39.1 
 
 		 181 aa  118  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000333382  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4682  rod shape-determining protein MreD  38.46 
 
 		 181 aa  117  6e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.812613  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4348  rod shape-determining protein MreD  38.46 
 
 		 181 aa  117  6e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4296  rod shape-determining protein MreD  39.74 
 
 		 181 aa  117  7.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4530  rod shape-determining protein MreD  38.46 
 
 		 181 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3165  rod shape-determining protein MreD  39.1 
 
 		 180 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0665  rod shape-determining protein MreD  37.82 
 
 		 181 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00876322  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4569  rod shape-determining protein MreD  38.46 
 
 		 181 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.145976  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1212  rod shape-determining protein MreD, putative  28.46 
 
 		 173 aa  55.1  0.0000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00000010227  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0254  rod shape-determining protein MreD  31.67 
 
 		 162 aa  48.9  0.00004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.0028978  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0175  rod shape-determining protein MreD  33.33 
 
 		 172 aa  48.9  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0265  rod shape-determining protein MreD  30 
 
 		 162 aa  45.8  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.151432  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0467  rod shape-determining protein MreD  29.46 
 
 		 162 aa  45.8  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00113622  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1196  rod shape-determining protein MreD  29.46 
 
 		 162 aa  45.8  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00178529  hitchhiker  0.00199386 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0400  rod shape-determining protein MreD  29.46 
 
 		 162 aa  45.8  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.269342  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3675  rod shape-determining protein MreD  26.72 
 
 		 162 aa  44.7  0.0007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0136907  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0356  rod shape-determining protein MreD  30.43 
 
 		 172 aa  43.5  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4409  rod shape-determining protein MreD  28.68 
 
 		 162 aa  43.9  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000516669  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0144  rod shape-determining protein MreD  34.75 
 
 		 170 aa  43.9  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.825294  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1738  rod shape-determining protein MreD  26.92 
 
 		 176 aa  43.5  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00003782  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1705  rod shape-determining protein MreD  26.92 
 
 		 176 aa  43.5  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000037059  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0050  rod shape-determining protein MreD  31.58 
 
 		 170 aa  42.7  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3685  rod shape-determining protein MreD  29.58 
 
 		 162 aa  42  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00121025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2023  rod shape-determining protein MreD  34.48 
 
 		 174 aa  41.6  0.006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0751594  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0324  rod shape-determining protein MreD  30.7 
 
 		 170 aa  41.2  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4400  rod shape-determining protein MreD  30.7 
 
 		 170 aa  41.2  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.104844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0224  putative rod shape-determining MreD transmembrane protein  25.86 
 
 		 172 aa  41.2  0.007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0053  rod shape-determining protein MreD  34.29 
 
 		 170 aa  40.8  0.009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00417177  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>