29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_2547 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012793  GWCH70_2547  rod shape-determining protein MreD  100 
 
 		 172 aa  344  3e-94  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000782724  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0902  rod shape-determining protein MreD  71.51 
 
 		 172 aa  240  7e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0665  rod shape-determining protein MreD  38.37 
 
 		 181 aa  121  5e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00876322  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4569  rod shape-determining protein MreD  38.37 
 
 		 181 aa  120  8e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.145976  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3165  rod shape-determining protein MreD  38.61 
 
 		 180 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4530  rod shape-determining protein MreD  38.95 
 
 		 181 aa  118  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4184  rod shape-determining protein  38.37 
 
 		 181 aa  118  4.9999999999999996e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4195  rod shape-determining protein  38.37 
 
 		 181 aa  118  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4348  rod shape-determining protein MreD  38.37 
 
 		 181 aa  117  6e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4682  rod shape-determining protein MreD  38.37 
 
 		 181 aa  117  6e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.812613  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4296  rod shape-determining protein MreD  38.73 
 
 		 181 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4542  rod shape-determining protein MreD  38.46 
 
 		 181 aa  115  3e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4584  rod shape-determining protein MreD  38.46 
 
 		 181 aa  115  3e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000333382  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1212  rod shape-determining protein MreD, putative  29.34 
 
 		 173 aa  67.4  0.00000000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00000010227  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1705  rod shape-determining protein MreD  30.65 
 
 		 176 aa  53.9  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000037059  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1738  rod shape-determining protein MreD  30.65 
 
 		 176 aa  53.9  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00003782  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2535  rod shape-determining protein MreD  28 
 
 		 175 aa  49.3  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1822  rod shape-determining protein MreD  30.08 
 
 		 173 aa  48.9  0.00004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0254  rod shape-determining protein MreD  31.06 
 
 		 162 aa  47.8  0.00008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.0028978  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0265  rod shape-determining protein MreD  30.3 
 
 		 162 aa  47  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.151432  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0400  rod shape-determining protein MreD  30.23 
 
 		 162 aa  45.1  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.269342  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0467  rod shape-determining protein MreD  30.23 
 
 		 162 aa  45.1  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00113622  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1196  rod shape-determining protein MreD  30.23 
 
 		 162 aa  45.1  0.0005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00178529  hitchhiker  0.00199386 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2023  rod shape-determining protein MreD  31.58 
 
 		 174 aa  44.3  0.0009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0751594  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3675  rod shape-determining protein MreD  26.83 
 
 		 162 aa  42.4  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0136907  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0514  rod shape-determining protein MreD  26.8 
 
 		 178 aa  42.4  0.003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0061  rod shape-determining MRED transmembrane protein  35.71 
 
 		 170 aa  41.2  0.006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.211296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3685  rod shape-determining protein MreD  25.95 
 
 		 162 aa  40.8  0.008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00121025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4409  rod shape-determining protein MreD  27.91 
 
 		 162 aa  40.8  0.009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000516669  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>