27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_1841 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012793  GWCH70_2726    99.9 
 
 		 2322 bp  1984    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.936477  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1841    100 
 
 		 2645 bp  5243    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2700    83.05 
 
 		 2428 bp  620  1e-175  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2440  AMP-binding domain protein  82.47 
 
 		 1635 bp  460  1.0000000000000001e-126  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0663  AMP-binding domain protein  91.53 
 
 		 1644 bp  77.8  0.00000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.390649  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1585  AMP-binding domain protein  89.83 
 
 		 1650 bp  69.9  0.000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2068  AMP-binding domain protein  89.66 
 
 		 1791 bp  67.9  0.00000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0234  AMP-dependent synthetase and ligase  84.27 
 
 		 2532 bp  65.9  0.00000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000591284  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0327  AMP-binding domain protein  87.5 
 
 		 1650 bp  63.9  0.0000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.347146  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1963  AMP-binding domain protein  81.51 
 
 		 1683 bp  61.9  0.0000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.17114  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2357  AMP-binding domain protein  88.89 
 
 		 1713 bp  60  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0641132  normal  0.0814981 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1813  AMP-binding domain protein  94.74 
 
 		 1683 bp  60  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.659175  normal  0.258259 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2063  hypothetical protein  87.93 
 
 		 366 bp  60  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00290473  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2563  AMP-binding domain protein  84.15 
 
 		 1650 bp  60  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45341e-16 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1103  AMP-binding domain protein  88.68 
 
 		 1659 bp  58  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0582  AMP-binding domain protein  92.11 
 
 		 1764 bp  52  0.0008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.44238  normal  0.647319 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2475  AMP-binding domain protein  87.04 
 
 		 1725 bp  52  0.0008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0776889  normal  0.707205 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0108  AMP-binding domain protein  90.48 
 
 		 1728 bp  52  0.0008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.480818  normal  0.901201 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4355  AMP-binding domain protein  90.48 
 
 		 1734 bp  52  0.0008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1650  AMP-binding domain protein  82.93 
 
 		 1650 bp  52  0.0008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0789  AMP-dependent synthetase and ligase  85.48 
 
 		 1662 bp  52  0.0008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.109867  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2285  AMP-binding domain protein  87.04 
 
 		 1713 bp  52  0.0008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0389499  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1971  AMP-binding domain protein  88.89 
 
 		 1737 bp  50.1  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0403  AMP-binding domain protein  81.44 
 
 		 1653 bp  50.1  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.493287  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0557  AMP-binding domain protein  85.96 
 
 		 1650 bp  50.1  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2699  AMP-binding enzyme, putative long chain fatty acid Co-A ligase, acetyl-CoA synthetase  100 
 
 		 1545 bp  50.1  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1389  AMP-binding domain protein  90.24 
 
 		 1650 bp  50.1  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000722424  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>