38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_0830 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_0818  putative IS transposase  100 
 
 
487 aa  1014    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0252983  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0830  putative IS transposase  100 
 
 
487 aa  1014    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0029  hypothetical protein  44.89 
 
 
498 aa  428  1e-118  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.514953  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1964  transposase, IS605 family  33.76 
 
 
514 aa  232  1e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.921525 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1471  transposase, IS608 family  34.4 
 
 
510 aa  215  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0400637 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5283  transposase, IS608 family  34.4 
 
 
510 aa  215  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.39642 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3297  IS891/IS1136/IS1341 family transposase  26.69 
 
 
307 aa  62  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.445227  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2046  putative transposase IS891/IS1136/IS1341 family  22.54 
 
 
424 aa  55.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1677  putative transposase IS605 family  34.03 
 
 
449 aa  53.9  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3489  transposase, IS605 OrfB family  24.78 
 
 
409 aa  53.5  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0122  transposase  23.01 
 
 
402 aa  49.3  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2738  transposase  23.98 
 
 
370 aa  50.1  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0501233  hitchhiker  0.000170929 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3701  transposase  23.89 
 
 
370 aa  48.9  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000275581  normal  0.14364 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3049  transposase  25.67 
 
 
370 aa  48.9  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00782519  normal  0.671104 
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3755  transposase  23.7 
 
 
393 aa  48.5  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3743  transposase  23.74 
 
 
300 aa  48.1  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1657  transposase  26.2 
 
 
311 aa  47.8  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3241  transposase  24.31 
 
 
370 aa  47.8  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.14303 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1973  transposase  25.67 
 
 
370 aa  47.4  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.662748  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0256  ISHa1675 transposase B  24.77 
 
 
413 aa  47  0.0007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1254  ISHa1675 transposase B  24.77 
 
 
413 aa  47  0.0007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0163601  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1726  ISHa1675 transposase B  24.77 
 
 
413 aa  47  0.0007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.773087  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1337  putative transposase IS891/IS1136/IS1341 family  21.82 
 
 
424 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1410  putative transposase IS891/IS1136/IS1341 family  22.06 
 
 
424 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.228401  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0840  putative transposase IS891/IS1136/IS1341 family  21.82 
 
 
424 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0586  putative transposase IS891/IS1136/IS1341 family  21.82 
 
 
424 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0278  ISCpe4, transposase  24.62 
 
 
396 aa  46.2  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2043  transposase  23.53 
 
 
370 aa  45.4  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.087211  normal  0.244149 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2694  transposase  25.13 
 
 
370 aa  45.4  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.240385  normal  0.200603 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2882  transposase  23.48 
 
 
393 aa  45.8  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.201197  normal  0.164603 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1883  transposase, IS605 OrfB family  20.56 
 
 
394 aa  44.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1857  transposase, IS605 OrfB family  20.56 
 
 
394 aa  44.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1181  transposase IS605 OrfB  25.74 
 
 
270 aa  44.7  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4522  putative transposase IS891/IS1136/IS1341 family  21.82 
 
 
424 aa  44.7  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  normal  0.839734 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1366  putative transposase IS891/IS1136/IS1341 family  21.58 
 
 
424 aa  44.7  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.241036 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0746  ISCpe4, transposase  24.23 
 
 
399 aa  44.7  0.004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.113079  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0845  IS605 family transposase OrfB  27.22 
 
 
381 aa  43.9  0.007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0714  IS605 family transposase OrfB  27.22 
 
 
381 aa  43.9  0.007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>