16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_5283 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_1471  transposase, IS608 family  100 
 
 
510 aa  1046    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0400637 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5283  transposase, IS608 family  100 
 
 
510 aa  1046    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.39642 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1964  transposase, IS605 family  63.67 
 
 
514 aa  623  1e-177  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.921525 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0818  putative IS transposase  34.54 
 
 
487 aa  219  7e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0252983  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0830  putative IS transposase  34.54 
 
 
487 aa  219  7e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0029  hypothetical protein  32.98 
 
 
498 aa  183  6e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.514953  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3297  IS891/IS1136/IS1341 family transposase  24.29 
 
 
307 aa  52  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.445227  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1366  putative transposase IS891/IS1136/IS1341 family  23.56 
 
 
424 aa  46.6  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.241036 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1410  putative transposase IS891/IS1136/IS1341 family  23.56 
 
 
424 aa  46.6  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.228401  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1600  putative transposase IS891/IS1136/IS1341 family  23.56 
 
 
424 aa  46.6  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.39272 
 
 
-
 
NC_013168  Cyan8802_4643  putative transposase IS891/IS1136/IS1341 family  23.56 
 
 
424 aa  46.6  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3814  transposase, IS605 OrfB family  24.8 
 
 
363 aa  44.3  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000135622  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0586  putative transposase IS891/IS1136/IS1341 family  23.26 
 
 
424 aa  43.5  0.009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0840  putative transposase IS891/IS1136/IS1341 family  23.26 
 
 
424 aa  43.5  0.009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0457  transposase, IS605 OrfB family  23.18 
 
 
363 aa  43.5  0.01  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.196449 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2689  transposase, IS605 OrfB family  24.03 
 
 
363 aa  43.5  0.01  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>