15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_1964 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_1964  transposase, IS605 family  100 
 
 
514 aa  1055    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.921525 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1471  transposase, IS608 family  63.53 
 
 
510 aa  619  1e-176  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0400637 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5283  transposase, IS608 family  63.53 
 
 
510 aa  619  1e-176  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.39642 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0818  putative IS transposase  33.76 
 
 
487 aa  232  2e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0252983  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0830  putative IS transposase  33.76 
 
 
487 aa  232  2e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0029  hypothetical protein  29.59 
 
 
498 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.514953  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2012  transposase, IS605 OrfB family  23.18 
 
 
362 aa  53.9  0.000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.27721  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3297  IS891/IS1136/IS1341 family transposase  26.83 
 
 
307 aa  52.4  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.445227  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3489  transposase, IS605 OrfB family  26.09 
 
 
409 aa  50.4  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1224  transposase, IS605 OrfB family  25.34 
 
 
425 aa  48.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2909  transposase, IS605 OrfB family  23.53 
 
 
396 aa  47.8  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3994  transposase, IS605 OrfB family  23.53 
 
 
396 aa  47.8  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.437884  normal  0.653956 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3945  transposase, IS605 OrfB family  23.53 
 
 
413 aa  47.4  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3814  transposase, IS605 OrfB family  22.88 
 
 
363 aa  44.3  0.006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000135622  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2689  transposase, IS605 OrfB family  21.94 
 
 
363 aa  43.5  0.008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>