35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1489 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1489  hypothetical protein  100 
 
 		 623 aa  1265    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.124741  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2684  hypothetical protein  64.35 
 
 		 621 aa  853    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.427064  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2597  hypothetical protein  59.07 
 
 		 619 aa  721    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1391  hypothetical protein  72.98 
 
 		 619 aa  889    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.86997 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2515  hypothetical protein  54.83 
 
 		 652 aa  695    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0758792  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1629  hypothetical protein  59.42 
 
 		 619 aa  721    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1651  hypothetical protein  46.35 
 
 		 624 aa  520  1e-146  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2017  hypothetical protein  24.27 
 
 		 880 aa  119  9.999999999999999e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.000248245  normal  0.284056 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0051  hypothetical protein  27.57 
 
 		 613 aa  111  3e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.062012 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1010  hypothetical protein  24.1 
 
 		 634 aa  107  5e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000101857  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2374  hypothetical protein  27.94 
 
 		 881 aa  102  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0423348  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0223  hypothetical protein  36.27 
 
 		 881 aa  102  3e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0333  hypothetical protein  32.55 
 
 		 880 aa  95.5  3e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0935  hypothetical protein  25.09 
 
 		 531 aa  92.4  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0581  hypothetical protein  29.53 
 
 		 1009 aa  92.4  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.272409  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2186  hypothetical protein  30.94 
 
 		 882 aa  90.9  6e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.000000183684  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2243  hypothetical protein  28.53 
 
 		 875 aa  86.7  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2144  hypothetical protein  33.17 
 
 		 1099 aa  86.7  0.000000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1528  hypothetical protein  30.95 
 
 		 984 aa  84.7  0.000000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0809349 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0307  hypothetical protein  29.35 
 
 		 993 aa  82.4  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2085  hypothetical protein  27.27 
 
 		 989 aa  82.4  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2927  hypothetical protein  26.54 
 
 		 1001 aa  82.8  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000253968 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4667  hypothetical protein  27.98 
 
 		 1076 aa  82.8  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0836755  hitchhiker  0.00000000312371 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0932  hypothetical protein  27.42 
 
 		 541 aa  82  0.00000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.315139  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0197  hypothetical protein  27.36 
 
 		 880 aa  81.6  0.00000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.267053  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4967  hypothetical protein  29.36 
 
 		 991 aa  79.7  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.736334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0773  hypothetical protein  23.71 
 
 		 455 aa  79  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000042468  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0238  hypothetical protein  31.1 
 
 		 947 aa  78.2  0.0000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1844  hypothetical protein  26.06 
 
 		 1005 aa  75.9  0.000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0832694 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1794  hypothetical protein  31.33 
 
 		 1245 aa  75.9  0.000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.69552  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01380  hypothetical protein  24.88 
 
 		 1109 aa  73.2  0.00000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.369989  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1626  hypothetical protein  25 
 
 		 1093 aa  70.9  0.00000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0968  conserved hypothetical protein, membrane  27.09 
 
 		 1103 aa  68.6  0.0000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.688922  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1942  hypothetical protein  24.86 
 
 		 580 aa  68.6  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0873468  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0195  hypothetical protein  27.72 
 
 		 522 aa  65.9  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.966603  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>