22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0195 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_0195  hypothetical protein  100 
 
 		 522 aa  1015    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.966603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0095  hypothetical protein  74.58 
 
 		 514 aa  647    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0932  hypothetical protein  35.14 
 
 		 541 aa  84.7  0.000000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.315139  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1942  hypothetical protein  41.22 
 
 		 580 aa  82  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0873468  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1794  hypothetical protein  27.96 
 
 		 1245 aa  75.9  0.000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.69552  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0333  hypothetical protein  32.65 
 
 		 880 aa  75.1  0.000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2374  hypothetical protein  30.61 
 
 		 881 aa  67.4  0.0000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0423348  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1489  hypothetical protein  28.54 
 
 		 623 aa  66.2  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.124741  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0935  hypothetical protein  35.98 
 
 		 531 aa  66.6  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2684  hypothetical protein  24.78 
 
 		 621 aa  62  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.427064  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0197  hypothetical protein  32.65 
 
 		 880 aa  59.3  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.267053  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2515  hypothetical protein  25.22 
 
 		 652 aa  57.4  0.0000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0758792  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0223  hypothetical protein  29.83 
 
 		 881 aa  56.2  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2017  hypothetical protein  26.24 
 
 		 880 aa  54.7  0.000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.000248245  normal  0.284056 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2186  hypothetical protein  29.08 
 
 		 882 aa  53.1  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.000000183684  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2597  hypothetical protein  25.55 
 
 		 619 aa  52.4  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0051  hypothetical protein  31.86 
 
 		 613 aa  49.7  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.062012 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1651  hypothetical protein  25.59 
 
 		 624 aa  48.9  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1629  hypothetical protein  25.38 
 
 		 619 aa  49.3  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2243  hypothetical protein  35.16 
 
 		 875 aa  46.6  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0773  hypothetical protein  31.29 
 
 		 455 aa  45.1  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000042468  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0238  hypothetical protein  32.03 
 
 		 947 aa  43.9  0.006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>