31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0968 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_01380  hypothetical protein  56.02 
 
 
1109 aa  1196    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.369989  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0968  conserved hypothetical protein, membrane  100 
 
 
1103 aa  2273    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.688922  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1626  hypothetical protein  54.31 
 
 
1093 aa  1155    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0581  hypothetical protein  35.98 
 
 
1009 aa  627  1e-178  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.272409  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2927  hypothetical protein  36.49 
 
 
1001 aa  605  1.0000000000000001e-171  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000253968 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4667  hypothetical protein  34.21 
 
 
1076 aa  601  1e-170  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0836755  hitchhiker  0.00000000312371 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0307  hypothetical protein  36.2 
 
 
993 aa  601  1e-170  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1528  hypothetical protein  35 
 
 
984 aa  597  1e-169  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0809349 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4967  hypothetical protein  36.6 
 
 
991 aa  598  1e-169  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.736334  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1844  hypothetical protein  32.85 
 
 
1005 aa  547  1e-154  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0832694 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2085  hypothetical protein  33.59 
 
 
989 aa  538  1e-151  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG2144  hypothetical protein  32.82 
 
 
1099 aa  528  1e-148  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0238  hypothetical protein  30.28 
 
 
947 aa  251  8e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2017  hypothetical protein  37.01 
 
 
880 aa  213  2e-53  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.000248245  normal  0.284056 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2243  hypothetical protein  28.82 
 
 
875 aa  208  4e-52  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2374  hypothetical protein  36.1 
 
 
881 aa  204  6e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0423348  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0333  hypothetical protein  29.59 
 
 
880 aa  201  5e-50  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2186  hypothetical protein  35.04 
 
 
882 aa  197  7e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.000000183684  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0197  hypothetical protein  36.41 
 
 
880 aa  188  5e-46  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.267053  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0223  hypothetical protein  34.94 
 
 
881 aa  179  2e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2597  hypothetical protein  30.26 
 
 
619 aa  72  0.00000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1629  hypothetical protein  29.74 
 
 
619 aa  67  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2684  hypothetical protein  25.63 
 
 
621 aa  67  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.427064  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1794  hypothetical protein  23.89 
 
 
1245 aa  66.6  0.000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.69552  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2515  hypothetical protein  31.25 
 
 
652 aa  57  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0758792  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1489  hypothetical protein  25.86 
 
 
623 aa  56.2  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.124741  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1651  hypothetical protein  25 
 
 
624 aa  56.2  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0051  hypothetical protein  27.51 
 
 
613 aa  53.9  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.062012 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1391  hypothetical protein  27.65 
 
 
619 aa  50.4  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.86997 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1942  hypothetical protein  25.95 
 
 
580 aa  50.1  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0873468  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1010  hypothetical protein  24.31 
 
 
634 aa  46.6  0.003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000101857  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>