35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_2243 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_2243  hypothetical protein  100 
 
 
875 aa  1787    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0223  hypothetical protein  62.38 
 
 
881 aa  1061    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0197  hypothetical protein  60.69 
 
 
880 aa  1048    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.267053  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2186  hypothetical protein  61.35 
 
 
882 aa  1090    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.000000183684  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2017  hypothetical protein  67.67 
 
 
880 aa  1201    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.000248245  normal  0.284056 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2374  hypothetical protein  61.1 
 
 
881 aa  1093    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0423348  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0333  hypothetical protein  61.93 
 
 
880 aa  1130    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0238  hypothetical protein  38.13 
 
 
947 aa  554  1e-156  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0307  hypothetical protein  33.27 
 
 
993 aa  481  1e-134  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1528  hypothetical protein  31.96 
 
 
984 aa  442  9.999999999999999e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0809349 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4967  hypothetical protein  34.48 
 
 
991 aa  430  1e-119  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.736334  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0581  hypothetical protein  30.96 
 
 
1009 aa  429  1e-118  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.272409  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2085  hypothetical protein  32.58 
 
 
989 aa  429  1e-118  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1844  hypothetical protein  31.64 
 
 
1005 aa  414  1e-114  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0832694 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2927  hypothetical protein  30.96 
 
 
1001 aa  391  1e-107  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000253968 
 
 
-
 
NC_002950  PG2144  hypothetical protein  30.1 
 
 
1099 aa  266  1e-69  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4667  hypothetical protein  30.81 
 
 
1076 aa  261  3e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0836755  hitchhiker  0.00000000312371 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1626  hypothetical protein  29.41 
 
 
1093 aa  219  2e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01380  hypothetical protein  29.31 
 
 
1109 aa  208  3e-52  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.369989  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0968  conserved hypothetical protein, membrane  35.86 
 
 
1103 aa  191  5.999999999999999e-47  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.688922  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2684  hypothetical protein  33.16 
 
 
621 aa  95.1  5e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.427064  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2515  hypothetical protein  29.48 
 
 
652 aa  88.6  5e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0758792  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1794  hypothetical protein  34.25 
 
 
1245 aa  88.6  5e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.69552  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1651  hypothetical protein  28.28 
 
 
624 aa  86.7  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2597  hypothetical protein  31.35 
 
 
619 aa  87  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1489  hypothetical protein  27.67 
 
 
623 aa  81.6  0.00000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.124741  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1629  hypothetical protein  28.3 
 
 
619 aa  81.3  0.00000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1010  hypothetical protein  30.11 
 
 
634 aa  80.1  0.0000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000101857  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1391  hypothetical protein  34.5 
 
 
619 aa  79.3  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.86997 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0051  hypothetical protein  32.99 
 
 
613 aa  77.4  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.062012 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0932  hypothetical protein  31.94 
 
 
541 aa  67  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.315139  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0773  hypothetical protein  30.3 
 
 
455 aa  56.6  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000042468  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1942  hypothetical protein  28.57 
 
 
580 aa  52.4  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0873468  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0195  hypothetical protein  29.75 
 
 
522 aa  47.4  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.966603  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0935  hypothetical protein  25.13 
 
 
531 aa  46.2  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>