32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0935 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0935  hypothetical protein  100 
 
 
531 aa  1064    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0932  hypothetical protein  49.54 
 
 
541 aa  400  9.999999999999999e-111  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.315139  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1241  hypothetical protein  55.87 
 
 
521 aa  375  1e-103  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2684  hypothetical protein  28.06 
 
 
621 aa  120  4.9999999999999996e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.427064  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1489  hypothetical protein  24.33 
 
 
623 aa  95.1  3e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.124741  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2515  hypothetical protein  25.86 
 
 
652 aa  94.7  4e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0758792  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1651  hypothetical protein  25.9 
 
 
624 aa  93.2  1e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1629  hypothetical protein  25.27 
 
 
619 aa  82.8  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2597  hypothetical protein  26.27 
 
 
619 aa  83.2  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1794  hypothetical protein  33.33 
 
 
1245 aa  79.7  0.0000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.69552  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1391  hypothetical protein  26.36 
 
 
619 aa  75.1  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.86997 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0051  hypothetical protein  26.44 
 
 
613 aa  69.3  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.062012 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0333  hypothetical protein  29 
 
 
880 aa  63.2  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0195  hypothetical protein  26.86 
 
 
522 aa  63.5  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.966603  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1942  hypothetical protein  27.74 
 
 
580 aa  62.8  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0873468  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1010  hypothetical protein  22.06 
 
 
634 aa  60.8  0.00000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000101857  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0095  hypothetical protein  28.15 
 
 
514 aa  60.1  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2374  hypothetical protein  27.86 
 
 
881 aa  59.7  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0423348  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0581  hypothetical protein  26.13 
 
 
1009 aa  59.3  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.272409  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1528  hypothetical protein  26.67 
 
 
984 aa  59.3  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0809349 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0223  hypothetical protein  27.78 
 
 
881 aa  57  0.0000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0773  hypothetical protein  23.92 
 
 
455 aa  56.2  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000042468  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2144  hypothetical protein  25.7 
 
 
1099 aa  55.1  0.000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2017  hypothetical protein  26.04 
 
 
880 aa  52.8  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.000248245  normal  0.284056 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0197  hypothetical protein  28.8 
 
 
880 aa  53.1  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.267053  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0307  hypothetical protein  23.3 
 
 
993 aa  51.6  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1844  hypothetical protein  24.12 
 
 
1005 aa  50.8  0.00006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0832694 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4667  hypothetical protein  23.65 
 
 
1076 aa  50.8  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0836755  hitchhiker  0.00000000312371 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4967  hypothetical protein  24.12 
 
 
991 aa  49.7  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.736334  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2243  hypothetical protein  26.67 
 
 
875 aa  47.8  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2927  hypothetical protein  25.26 
 
 
1001 aa  45.8  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000253968 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2186  hypothetical protein  24.88 
 
 
882 aa  44.7  0.004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.000000183684  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>