32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0307 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_1528  hypothetical protein  47.11 
 
 
984 aa  921    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0809349 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4667  hypothetical protein  40.74 
 
 
1076 aa  714    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0836755  hitchhiker  0.00000000312371 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2927  hypothetical protein  44.07 
 
 
1001 aa  697    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000253968 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0581  hypothetical protein  47.41 
 
 
1009 aa  802    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.272409  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0307  hypothetical protein  100 
 
 
993 aa  2048    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4967  hypothetical protein  49.9 
 
 
991 aa  947    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.736334  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2085  hypothetical protein  45.19 
 
 
989 aa  845    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1844  hypothetical protein  39.11 
 
 
1005 aa  727    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0832694 
 
 
-
 
NC_002950  PG2144  hypothetical protein  39.04 
 
 
1099 aa  633  1e-180  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01380  hypothetical protein  35.91 
 
 
1109 aa  597  1e-169  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.369989  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0968  conserved hypothetical protein, membrane  36.1 
 
 
1103 aa  575  1.0000000000000001e-162  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.688922  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0238  hypothetical protein  35.16 
 
 
947 aa  513  1e-144  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0333  hypothetical protein  33.17 
 
 
880 aa  491  1e-137  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2243  hypothetical protein  35.29 
 
 
875 aa  471  1.0000000000000001e-131  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2017  hypothetical protein  31.88 
 
 
880 aa  462  9.999999999999999e-129  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.000248245  normal  0.284056 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2374  hypothetical protein  31.96 
 
 
881 aa  456  1e-127  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0423348  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2186  hypothetical protein  33.13 
 
 
882 aa  454  1.0000000000000001e-126  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.000000183684  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0197  hypothetical protein  34.87 
 
 
880 aa  444  1e-123  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.267053  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0223  hypothetical protein  31.48 
 
 
881 aa  440  9.999999999999999e-123  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1626  hypothetical protein  35.41 
 
 
1093 aa  368  1e-100  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2684  hypothetical protein  27.89 
 
 
621 aa  76.6  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.427064  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2597  hypothetical protein  30.05 
 
 
619 aa  73.6  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1629  hypothetical protein  25 
 
 
619 aa  72.8  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1651  hypothetical protein  26.2 
 
 
624 aa  71.2  0.00000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1489  hypothetical protein  29.35 
 
 
623 aa  70.9  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.124741  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1794  hypothetical protein  26.64 
 
 
1245 aa  69.3  0.0000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.69552  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2515  hypothetical protein  22.22 
 
 
652 aa  67.4  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0758792  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0051  hypothetical protein  28.71 
 
 
613 aa  65.9  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.062012 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1391  hypothetical protein  26.89 
 
 
619 aa  62  0.00000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.86997 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0773  hypothetical protein  27.82 
 
 
455 aa  55.5  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000042468  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1010  hypothetical protein  24.88 
 
 
634 aa  53.9  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000101857  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0932  hypothetical protein  25.65 
 
 
541 aa  50.4  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.315139  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>